RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	MDM35	O60200	86 aa		4.36	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.36	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	SIM1	P40472	476 aa		4.36	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	YDR274C	P87283	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	PBA1	Q05778	276 aa		4.36	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.36	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	NRM1	P53718	249 aa		4.35	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	HKR1	P41809	1802 aa		4.35	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	IGO1	P53897	168 aa		4.35	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	YHP1	Q04116	353 aa		4.35	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	YPL261C	Q08976	102 aa		4.35	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	BSC1	Q12140	328 aa		4.35	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	UBR2	Q07963	1872 aa		4.34	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	PMD1	P32634	1753 aa		4.34	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	DSE2	P38844	325 aa		4.34	□□□□□ -1.71
VBA1	YMR088C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.33	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	RPS22A	P0C0W1	130 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YHL005C	P38752	130 aa		4.33	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YHR180W	P38868	163 aa		4.33	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	PCP1	P53259	346 aa		4.33	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	ROX3	P25046	220 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	FYV5	P25585	152 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YHR173C	P38864	112 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	PET8	P38921	284 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	LST8	P41318	303 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YOL014W	Q08110	124 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	PPT2	Q12036	173 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	NCA3	P46955	337 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	CRC1	Q12289	327 aa		4.32	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	MET31	Q03081	177 aa		4.31	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	IRC23	Q08416	157 aa		4.31	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YOR343C	Q12484	108 aa		4.31	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	COX9	P07255	59 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	IMP2	P46972	177 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YOL118C	Q08259	102 aa		4.3	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	PFY1	P07274	126 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YBR209W	P38311	105 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.29	□□□□□ -1.72	not detected
VBA1	YMR088C	YOR314W	Q12506	109 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.29	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	QCR10	P37299	77 aa		4.28	□□□□□ -1.72
VBA1	YMR088C	YAL065C	O13511	128 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	CTR2	P38865	189 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	SPI1	P40092	148 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YFL051C	P43552	160 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	ECO1	P43605	281 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	STT4	P37297	1900 aa		4.27	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YCR025C	P25352	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	AGA1	P32323	725 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	CRH1	P53301	507 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	COA2	Q3E823	68 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YCR043C	P25361	127 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	AIM19	P40502	157 aa		4.26	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YAR023C	D6VPM8	179 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	MTC6	P38849	526 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YML122C	Q03207	126 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	FYV12	Q08559	129 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	TIM22	Q12328	207 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		4.25	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YPR096C	O13587	100 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	ATP15	P21306	62 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	QCR9	P22289	66 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YCR041W	P37265	110 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	ATP19	P81451	68 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	LIP1	Q03579	150 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	OST5	Q92316	86 aa		4.24	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	TVP23	P38962	199 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	TRS23	Q03784	219 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YLR162W	Q06235	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YEL073C	P39974	107 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YIL163C	P40448	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YPI1	P43587	155 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	SOM1	Q05676	74 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	IRC19	Q07843	230 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	ATP20	Q12233	115 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	UTH1	P36135	365 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	MPC3	P53311	146 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	MRPS8	Q03799	155 aa		4.22	□□□□□ -1.73
VBA1	YMR088C	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VBA1	YMR088C	YLR156W	P0CE96	114 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VBA1	YMR088C	YLR159W	P0CE97	114 aa		4.21	□□□□□ -1.74
VBA1	YMR088C	YLR161W	P0CE98	114 aa		4.21	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms