RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W HAC1P41546 238 aa6.45□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YGL230CP53074 147 aa6.45□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YMR103CQ04436 120 aa6.45□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YDL157CQ12082 118 aa6.45□□□□□ -1.38
DDI1YER143W FYV7Q12247 151 aa6.45□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa6.45□□□□□ -1.38
DDI1YER143W SCS22Q6Q595 175 aa6.45□□□□□ -1.38
DDI1YER143W SGF11Q03067 99 aa6.44□□□□□ -1.38
DDI1YER143W MRPL44P19956 98 aa6.43□□□□□ -1.38
DDI1YER143W APS1P35181 156 aa6.43□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YPT53P36019 220 aa6.43□□□□□ -1.38
DDI1YER143W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
DDI1YER143W NAT5Q08689 176 aa6.43□□□□□ -1.38
DDI1YER143W MRP49P32388 137 aa6.42□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data6.42□□□□□ -1.38not detected
DDI1YER143W PMP3P87284 55 aa6.42□□□□□ -1.38
DDI1YER143W TRP1P00912 224 aa6.41□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YKL070WP36087 169 aa6.41□□□□□ -1.38
DDI1YER143W URM1P40554 99 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
DDI1YER143W BET5Q03630 159 aa6.41□□□□□ -1.38
DDI1YER143W HAL1Q01766 294 aa6.4□□□□□ -1.38
DDI1YER143W YDL022C-AP0C5L6 82 aa6.39□□□□□ -1.39
DDI1YER143W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
DDI1YER143W YGL088WP53151 121 aa6.39□□□□□ -1.39
DDI1YER143W CRC1Q12289 327 aa6.39□□□□□ -1.39
DDI1YER143W ADH2P00331 348 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
DDI1YER143W ATP5P09457 212 aa6.38□□□□□ -1.39
DDI1YER143W ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data6.38□□□□□ -1.39not detected
DDI1YER143W YMR122W-AQ3E842 84 aa6.38□□□□□ -1.39
DDI1YER143W YCR007CP25354 239 aa6.37□□□□□ -1.39
DDI1YER143W AIM29P36154 155 aa6.37□□□□□ -1.39
DDI1YER143W YBR209WP38311 105 aa6.37□□□□□ -1.39
DDI1YER143W YEL008WP40001 126 aa6.37□□□□□ -1.39
DDI1YER143W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
DDI1YER143W YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
DDI1YER143W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
DDI1YER143W YKL044WP36092 106 aa6.36□□□□□ -1.39
DDI1YER143W YIL059CP40520 121 aa6.36□□□□□ -1.39
DDI1YER143W ATP15P21306 62 aa6.35□□□□□ -1.39
DDI1YER143W ERI1P62651 68 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
DDI1YER143W YEL067CP39978 195 aa6.34□□□□□ -1.39
DDI1YER143W AIM11P87275 137 aa6.34□□□□□ -1.39
DDI1YER143W SAE3P89114 91 aa6.33□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YLR194CQ05777 254 aa6.33□□□□□ -1.4
DDI1YER143W PAU23Q07987 124 aa6.33□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YPL261CQ08976 102 aa6.33□□□□□ -1.4
DDI1YER143W PAU17Q12370 124 aa6.33□□□□□ -1.4
DDI1YER143W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
DDI1YER143W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YBR219CP38317 127 aa6.32□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa6.32□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YKR041WP36134 250 aa6.31□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YER085CP40058 173 aa6.31□□□□□ -1.4
DDI1YER143W LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YCL021W-AQ96VH3 125 aa6.31□□□□□ -1.4
DDI1YER143W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
DDI1YER143W RPL32P38061 130 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YPL073CP40323 161 aa6.3□□□□□ -1.4
DDI1YER143W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YNR077CP53758 84 aa6.3□□□□□ -1.4
DDI1YER143W RPR2P40571 144 aa6.29□□□□□ -1.4
DDI1YER143W SPC1P46965 94 aa6.29□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YAR029WP39549 74 aa6.28□□□□□ -1.4
DDI1YER143W YMR295CQ03559 197 aa6.28□□□□□ -1.4
DDI1YER143W ERG28P40030 148 aa6.27□□□□□ -1.41
DDI1YER143W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data6.27□□□□□ -1.41not detected
DDI1YER143W CIN5P40917 295 aa6.27□□□□□ -1.41
DDI1YER143W MRPS12P53732 153 aa6.27□□□□□ -1.41
DDI1YER143W YDR115WQ04598 105 aa6.27□□□□□ -1.41
DDI1YER143W SHU1P38751 150 aa6.26□□□□□ -1.41
DDI1YER143W YMR320WQ04897 101 aa6.26□□□□□ -1.41
DDI1YER143W PEX17P40155 199 aa6.25□□□□□ -1.41
DDI1YER143W PBA1Q05778 276 aa6.25□□□□□ -1.41
DDI1YER143W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa6.24□□□□□ -1.41
DDI1YER143W RPL18AP0CX49 186 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
DDI1YER143W RPL18BP0CX50 186 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
DDI1YER143W IGO2Q9P305 131 aa6.24□□□□□ -1.41
DDI1YER143W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
DDI1YER143W DIF1O13577 133 aa6.23□□□□□ -1.41
DDI1YER143W RPF1P38805 295 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
DDI1YER143W ENV10Q99382 181 aa6.23□□□□□ -1.41
DDI1YER143W COX14P39103 70 aa6.22□□□□□ -1.41
DDI1YER143W GLC8P41818 229 aa6.22□□□□□ -1.41
DDI1YER143W RTC6O14464 93 aa6.21□□□□□ -1.42
DDI1YER143W RPL28P02406 149 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
DDI1YER143W OXA1P39952 402 aa6.21□□□□□ -1.42
DDI1YER143W RPC10P40422 70 aa6.21□□□□□ -1.42
DDI1YER143W YFR057WP43625 151 aa6.21□□□□□ -1.42
DDI1YER143W YLR363W-AQ3E747 85 aa6.21□□□□□ -1.42
DDI1YER143W YAL065CO13511 128 aa6.2□□□□□ -1.42
DDI1YER143W HAP3P13434 144 aa6.2□□□□□ -1.42
DDI1YER143W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
DDI1YER143W YNL190WP53872 204 aa6.2□□□□□ -1.42
DDI1YER143W QCR8P08525 94 aa6.19□□□□□ -1.42
DDI1YER143W MHR1Q06630 226 aa6.19□□□□□ -1.42
DDI1YER143W YMR175W-AQ3E766 64 aa6.19□□□□□ -1.42
DDI1YER143W RRT15Q3E811 62 aa6.19□□□□□ -1.42
DDI1YER143W UGX2P32772 223 aa6.18□□□□□ -1.42
DDI1YER143W TOA2P32774 122 aa6.18□□□□□ -1.42
DDI1YER143W SVP26P38869 228 aa6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.8 ms