RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	YPR153W	Q06537	140 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	VPS68	Q12016	184 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	HPA3	P39979	161 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	YGL149W	P53116	101 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	KRE1	P17260	313 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	DCV1	P43595	202 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YMR321C	Q04898	105 aa		2.84	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	IPT1	P38954	527 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YER187W	P40102	141 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	FIT2	Q08906	153 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	ACC1	Q00955	2233 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	STF2	P16965	84 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	FUN14	P18411	198 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	PEP8	P40335	379 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	HUR1	P45820	110 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	BRP1	P53194	125 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	IGO1	P53897	168 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	ELP6	Q04868	273 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	DAD1	Q12248	94 aa		2.83	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	HMRA1	P0CY11	126 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	UTR5	P32630	166 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YPL261C	Q08976	102 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	MDM35	O60200	86 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	EMC5	P40540	141 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YFL051C	P43552	160 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	PAU12	P53343	120 aa		2.82	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	VMA21	P41806	77 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YPL067C	Q02754	198 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	SEN15	Q04675	128 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YLR296W	Q05898	108 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	AGA2	P32781	87 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YMR082C	Q04276	118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	GPI11	Q06636	219 aa		2.8	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YHR022C	P38763	256 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YEL014C	P39999	101 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	VPS13	Q07878	3144 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	ECM12	O13529	151 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	PAU2	P32612	120 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	YJL144W	P47009	104 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	MIX14	Q04341	121 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	OST5	Q92316	86 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	SRB6	P32570	121 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	MET31	Q03081	177 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	HSP150	P32478	413 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	CYT2	Q00873	224 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	HRT1	Q08273	121 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SYF1	YDR416W	EMC6	Q12431	108 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	PCC1	Q3E833	88 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	RTC6	O14464	93 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	PAU24	P38155	120 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	PAU19	P0CE85	124 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	PAU3	P25610	124 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	2.76	□□□□□ -1.97	not detected
SYF1	YDR416W	SNN1	P48232	102 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	AVO2	Q04749	426 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	RRT15	Q3E811	62 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	YKR045C	P36138	183 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	YHR007C-A	Q07074	71 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	FMP27	Q06179	2628 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	FMT1	P32785	401 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	RPB7	P34087	171 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	MHF1	Q3E835	90 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	YLR194C	Q05777	254 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	CYB5	P40312	120 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	HPA2	Q06592	156 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	DSE2	P38844	325 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	YIR020C	P40575	100 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	DAN1	P47178	298 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SYF1	YDR416W	QCR8	P08525	94 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	PAU16	P35994	123 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	SRX1	P36077	127 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	NRG2	P38082	220 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	COX23	P38824	151 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	PAU15	P40585	124 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	CWP2	P43497	92 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SYF1	YDR416W	YDR042C	Q03205	200 aa		2.71	□□□□□ -1.98

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