RNA–Protein interactions for RNA: YAL058W

CNE1, Transcript of Calnexin, yeast

Gene CNE1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CNE1	YAL058W	CIN5	P40917	295 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
CNE1	YAL058W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	POP7	P38291	140 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YER181C	P40097	107 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YPT53	P36019	220 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	GLO1	P50107	326 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	SRL1	Q08673	210 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	YPR013C	Q12145	317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	DYN1	P36022	4092 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CNE1	YAL058W	MIC12	P38341	106 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YHR022C	P38763	256 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	AIM34	Q03673	198 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	AIM11	P87275	137 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	PRM3	Q08931	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	VHS2	P40463	436 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	VAR1	P02381	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	PRM7	Q12459	698 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	ATP15	P21306	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	DCV1	P43595	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YDL186W	P48568	277 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	OST2	P46964	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YLR194C	Q05777	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	LSM6	Q06406	86 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YER085C	P40058	173 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YNL217W	P40152	326 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YJR146W	P47174	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YIP3	P53633	176 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	CCW12	Q12127	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	INO2	P26798	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	MID2	P36027	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	ATX1	P38636	73 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	KEG1	P43614	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	TOS8	P53147	276 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CNE1	YAL058W	INO4	P13902	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YCR041W	P37265	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	CAX4	P53223	239 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	MRPS12	P53732	153 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YNL190W	P53872	204 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YER135C	P40082	130 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YNL194C	P40169	301 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	HPA2	Q06592	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	Q0255	P03881	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YFR035C	P43608	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	VPS55	P47111	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	ISD11	Q6Q560	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	UGX2	P32772	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YFL065C	P43539	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	HOR7	Q05827	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YPR203W	Q08994	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	MIG3	P39943	394 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YGL088W	P53151	121 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YNL184C	P53876	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	SPG4	Q04438	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	SIM1	P40472	476 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	TRP1	P00912	224 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YBR209W	P38311	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	DSE2	P38844	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	PEX17	P40155	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	RRG8	Q06109	277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	YPL229W	Q99395	206 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNE1	YAL058W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	COX10	P21592	462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	SHU1	P38751	150 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	YEL008W	P40001	126 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	RRT13	P40042	185 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	YIA6	P40556	373 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	FIP1	P45976	327 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	TAR1	Q8TGM6	124 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	ABF2	Q02486	183 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	YCR075W-A	Q3E830	75 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	NRG2	P38082	220 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	KRE1	P17260	313 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	YHR130C	P38834	111 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CNE1	YAL058W	YIL059C	P40520	121 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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