RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	CUL4A	Q13619	759 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF827	Q17R98	1081 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MZB1	Q8WU39	189 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	AFG1L	Q8WV93	481 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	THAP4	Q8WY91	577 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	COG8	Q96MW5	612 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ASB1	Q9Y576	335 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA3	Q99758	1704 aa		5.52	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ACOT7	O00154	380 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	N4BP3	O15049	544 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM63A	O94886	807 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SYN1	P17600	705 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPK4	P31152	587 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IL13	P35225	146 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HERVK_113	P62684	666 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GRIN1	Q05586	938 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP2R5C	Q13362	524 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SNAPC2	Q13487	334 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC12A1	Q13621	1099 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KRT74	Q7RTS7	529 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	VSIG1	Q86XK7	387 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IGDCC3	Q8IVU1	814 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HIPK4	Q8NE63	616 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GAB3	Q8WWW8	586 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX21	Q969T3	373 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC46	Q96FV0	321 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	DPH1	Q9BZG8	443 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MTG2	Q9H4K7	406 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	DTL	Q9NZJ0	730 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	RGL1	Q9NZL6	768 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		5.51	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	LTN1	O94822	1766 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf81	C9J6K1	198 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA4L	O95757	839 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GYS1	P13807	737 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	IL1R1	P14778	569 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ATF2	P15336	505 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PFKL	P17858	780 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MAL	P21145	153 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PIK3CA	P42336	1068 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC6A9	P48067	706 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MMP14	P50281	582 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX16	P57768	344 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	SLFN5	Q08AF3	891 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP2B3	Q16720	1220 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	UNC13D	Q70J99	1090 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	MICU3	Q86XE3	530 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL10	Q8N8L6	244 aa		5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	5.5	□□□□□ -1.53
EFHC1-223	ENST00000636616	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		5.5	□□□□□ -1.53

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