RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152		E5RJQ4	531 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA8R	I6L899	631 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CXCL11	O14625	94 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM63A	O94886	807 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CDH6	P55285	790 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	AMHR2	Q16671	573 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	AFG1L	Q8WV93	481 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CLUH	O75153	1309 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	KRT4	P19013	534 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	SNCB	Q16143	134 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	CXorf38	Q8TB03	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	ECT2	Q9H8V3	914 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BRF1-222	ENST00000635152	MCF2L	O15068	1137 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ASMTL	O95671	621 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ARL4C	P56559	192 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KCNJ2	P63252	427 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP1	Q07960	439 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MGAT5	Q09328	741 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PALM2	Q8IXS6	379 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TTC13	Q8NBP0	860 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MGAM	O43451	1857 aa		13.71	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CYP3A5	P20815	502 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	OSBP	P22059	807 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MTFR1	Q15390	333 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SLC1A5	Q15758	541 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TRNP1	Q6NT89	227 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FAM228A	Q86W67	206 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	APOC2	P02655	101 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MCF2	P10911	925 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MOGS	Q13724	837 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	DPP3	Q9NY33	737 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GSTA1	P08263	222 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	P4HA1	P13674	534 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NCALD	P61601	193 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	TNFAIP2	Q03169	654 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	SPARCL1	Q14515	664 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	E2F5	Q15329	346 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	CHUK	O15111	745 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	AVIL	O75366	819 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BRF1-222	ENST00000635152	HMGCR	P04035	888 aa		13.69	□□□□□ -0.22

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