RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SMOQ99835 787 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRC5Q86WI3 1866 aa26.21■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CTNNA2P26232 953 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CDR1P51861 262 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 EPHB4P54760 987 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 MAP3K7CLP57077 242 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC6A3Q01959 620 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 SCUBE3Q8IX30 993 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CEP112Q8N8E3 955 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 ZMIZ2Q8NF64 920 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 IGSF21Q96ID5 467 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 PBKQ96KB5 322 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPZA3Q96KX2 299 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 UBXN6Q9BZV1 441 aa26.2■■□□□ 1.79
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM30AQ9NV96 361 aa26.2■■□□□ 1.79
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CAPNS1-215ENST00000628018 CACNA2D1P54289 1103 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM240Q5SV17 173 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNT2Q6UVM3 1135 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 NIPA2Q8N8Q9 360 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRN4CLQ8ND94 238 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 B3GALT6Q96L58 329 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM59LQ9UK28 342 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRDP23468 1912 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 ZBBXA8MT70 800 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 LCP1P13796 627 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 SCNN1AP37088 669 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 PEX5P50542 639 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 RTP2Q5QGT7 225 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF280DQ6N043 979 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 C4orf50Q6ZRC1 276 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS1R1Q7RTX1 841 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 UBL4BQ8N7F7 174 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 KRT35Q92764 455 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.784e-6■□□□□ 9.2
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CAPNS1-215ENST00000628018 RNF14Q9UBS8 474 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC66A2RUB6 948 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6C75A6NL08 312 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D4O60343 1298 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4Q2P0C623 313 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 BDNFP23560 247 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-215ENST00000628018 MNS1Q8NEH6 495 aa26.18■■□□□ 1.78
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF558Q96NG5 402 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNK16Q96T55 309 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TTPALQ9BTX7 342 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 HTATIP2Q9BUP3 242 aa26.18■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 HHLA1C9JL84 531 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.782e-11■■■□□ 17.4
CAPNS1-215ENST00000628018 MARCKSL1P49006 195 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A12Q504Y0 691 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 DCAF12L1Q5VU92 463 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A11Q8N1S5 342 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 YME1L1Q96TA2 773 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 VN1R3Q9BXE9 311 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CARD9Q9H257 536 aa26.17■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CARNS1A5YM72 827 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 F8VP50 259 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 GJB5O95377 273 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 SYN1P17600 705 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 LAG3P18627 525 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 ADIGQ0VDE8 80 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB41Q5JT25 222 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKS3Q6ZW76 656 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC26A9Q7LBE3 791 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CLEC4CQ8WTT0 213 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 MS4A14Q96JA4 679 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 LRRC4Q9HBW1 653 aa26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 C2CD4BA6NLJ0 364 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 H7C4K7 107 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 PSMA2P25787 234 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 ADCY1Q08828 1119 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TAF5Q15542 800 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 USP41Q3LFD5 358 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP221Q4G0U5 840 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 TRNP1Q6NT89 227 aa26.15■■□□□ 1.78
CAPNS1-215ENST00000628018 ARCQ7LC44 396 aa26.15■■□□□ 1.78
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