RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626257.2

CCZ1B-215, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, human

TSL 2 BASIC

Gene CCZ1B, Length 2,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCZ1B-215	ENST00000626257	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	CALN1	Q9BXU9	219 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	PPCS	Q9HAB8	311 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		27.6	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	MTFR1	Q15390	333 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	PEBP4	Q96S96	227 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	NDST1	P52848	882 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	SMC6	Q96SB8	1091 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	SENP1	Q9P0U3	644 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	CYP3A5	P20815	502 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	PCK1	P35558	622 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	RASA2	Q15283	850 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	GALNTL6	Q49A17	601 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	EFHC2	Q5JST6	749 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CCZ1B-215	ENST00000626257	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	PIK3R2	O00459	728 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	SSTR1	P30872	391 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	SLC18A1	P54219	525 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	INCA1	Q0VD86	236 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	CCDC63	Q8NA47	563 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RSAD1	Q9HA92	442 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	MCF2L	O15068	1137 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	ZNF286B	P0CG31	522 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	MMRN1	Q13201	1228 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	KYAT1	Q16773	422 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	TRNP1	Q6NT89	227 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	AFG1L	Q8WV93	481 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	DPP3	Q9NY33	737 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		27.57	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	TMEM63A	O94886	807 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RBP3	P10745	1247 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	GPD1	P21695	349 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RBP5	P82980	135 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RAB6C	Q53S08	254 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	SPATA18	Q8TC71	538 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	CNPY3	Q9BT09	278 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257		A0A1W2PPM1	405 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257		E7ESA3	106 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	CYP2C8	P10632	490 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	PHB	P35232	272 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	SPARCL1	Q14515	664 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	NLRP7	Q8WX94	980 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	ACAP3	Q96P50	834 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	TSPAN16	Q9UKR8	245 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	C2CD2	Q9Y426	696 aa		27.56	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257		E5RJQ4	531 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	TSPAN1	O60635	241 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	ENDOD1	O94919	500 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	CDH6	P55285	790 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	SNCB	Q16143	134 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	NPNT	Q6UXI9	565 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	FBXO36	Q8NEA4	188 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	PPTC7	Q8NI37	304 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	CD248	Q9HCU0	757 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	MGRN1	O60291	552 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	PDGFRA	P16234	1089 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	NRL	P54845	237 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	MTM1	Q13496	603 aa		27.55	■■■□□ 2
CCZ1B-215	ENST00000626257	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2

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