RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIK1P39086 918 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP27A1Q02318 531 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 HPS3Q969F9 1004 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 NME7Q9Y5B8 376 aa27.41■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CHD8Q9HCK8 2581 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TNNC2P02585 160 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PDGFRBP09619 1106 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 WARSP23381 471 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 C2orf27AQ580R0 203 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PCED1BQ96HM7 432 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO16Q9Y6X6 1858 aa27.4■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF233A6NK53 670 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PDCP20941 246 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PDE6CP51160 858 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 DUOXA2Q1HG44 320 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PMS2CLQ68D20 193 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 RASSF3Q86WH2 238 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC65Q8IXS2 484 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 PDILTQ8N807 584 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 CEP295NLQ96MC4 621 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 USP28Q96RU2 1077 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TTLL2Q9BWV7 592 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa27.39■■□□□ 1.98
CAPNS1-211ENST00000590874 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP17A1P05093 508 aa27.38■■□□□ 1.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 SYT1P21579 422 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA13P27216 316 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXD13P35453 343 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ANO7Q6IWH7 933 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR49Q8IV35 697 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC26Q8TAB7 109 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 MMS19Q96T76 1030 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF38Q9H0F5 515 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 HSPBP1Q9NZL4 362 aa27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 LNP1A1A4G5 178 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF840PA6NDX5 716 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf47A7E2U8 309 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 BCKDHBP21953 392 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SURF1Q15526 300 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 MDH1BQ5I0G3 518 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SFTPA1Q8IWL2 248 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC33Q8N5R6 958 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 MDGA1Q8NFP4 955 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 CPQQ9Y646 472 aa27.37■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 F8VP50 259 aa27.36■■□□□ 1.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 OLFM2O95897 454 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CACNA2D1P54289 1103 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A9P82251 487 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 MESP2Q0VG99 397 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC39A14Q15043 492 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM30AQ9NV96 361 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SMPD4Q9NXE4 827 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 USP24Q9UPU5 2620 aa27.36■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 HELZP42694 1942 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 NOP14P78316 857 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CRY1Q16526 586 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf48Q96LL4 319 aa27.35■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 PATE3B3GLJ2 98 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 GIPC1O14908 333 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 OAS1P00973 400 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
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CAPNS1-211ENST00000590874 SLC6A11P48066 632 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DHCR24Q15392 516 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM92Q6UXU6 159 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 HS2ST1Q7LGA3 356 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf74Q86VG3 221 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 SNX25Q9H3E2 840 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DPEP3Q9H4B8 488 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 EHD2Q9NZN4 543 aa27.34■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 ABL1P00519 1130 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 DLATP10515 647 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP3CCP48454 512 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF10Q12962 218 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 C12orf40Q86WS4 652 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 TTC30AQ86WT1 665 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 RDH13Q8NBN7 331 aa27.33■■□□□ 1.97
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6B3Q8NGW1 331 aa27.33■■□□□ 1.97
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