RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589769.1

EFTUD2-214, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 689 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC8A3P57103 927 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC6A3Q01959 620 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 C2orf54Q08AI8 447 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MFSD5Q6N075 450 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 KATNAL2Q8IYT4 538 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 MYLPFQ96A32 169 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SMARCD1Q96GM5 515 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
EFTUD2-214ENST00000589769 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 MYBPHLA2RUH7 354 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 C2CD4BA6NLJ0 364 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TBKBP1A7MCY6 615 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 CCDC188H7C350 402 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 NRP1O14786 923 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 DGKIO75912 1065 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 BAIAP3O94812 1187 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 EFEMP2O95967 443 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 FGFR3P22607 806 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TAS2R40P59535 323 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TSPY1Q01534 308 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 24.6
EFTUD2-214ENST00000589769 PIGZQ86VD9 579 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TSC1Q92574 1164 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 RUBCNQ92622 972 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 COLEC11Q9BWP8 271 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PLVAPQ9BX97 442 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PNPLA8Q9NP80 782 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ASNSD1Q9NWL6 643 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.95■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 CLDN5O00501 218 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 LRCH4O75427 683 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 GPD1P21695 349 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PSMA2P25787 234 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ADCY1Q08828 1119 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 RAB41Q5JT25 222 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TRNP1Q6NT89 227 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 SCML4Q8N228 414 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM199Q8N511 208 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ZMIZ2Q8NF64 920 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 SMOQ99835 787 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 CNPY3Q9BT09 278 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 MED10Q9BTT4 135 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.94■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PLXNA3P51805 1871 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 HHLA1C9JL84 531 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 F8VP50 259 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 AP1G2O75843 785 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 BEST1O76090 585 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 FBXO21O94952 628 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 FGGP02679 453 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 AMHP03971 560 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 GALTP07902 379 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PYGMP11217 842 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 CSF2RAP15509 400 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 RAG1P15918 1043 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PTPN7P35236 360 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PCK1P35558 622 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 FLT3P36888 993 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PTPN9P43378 593 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 FUT10Q6P4F1 479 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 EMC1Q8N766 993 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 EXD1Q8NHP7 514 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TOP1MTQ969P6 601 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 CWH43Q9H720 699 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 HCSTQ9UBK5 93 aa15.93■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 CARNS1A5YM72 827 aa15.92■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 OR6C75A6NL08 312 aa15.92■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 HSF2BPO75031 334 aa15.92■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 TADA2AO75478 443 aa15.92■□□□□ 0.14
EFTUD2-214ENST00000589769 DAB1O75553 588 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms