RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MLXIPQ9HAP2 919 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HOMER3Q9NSC5 361 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.58□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CLUHO75153 1309 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NRCAMQ92823 1304 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 H0Y626 953 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KCNK3O14649 394 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PPFIA4O75335 1185 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DGAT1O75907 488 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TRIM16O95361 564 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KRT10P13645 584 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TNFAIP3P21580 790 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GARTP22102 1010 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KLRC1P26715 233 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 YWHABP31946 246 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CCR3P51677 355 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 VAMP7P51809 220 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NCKAP1LP55160 1127 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SKOR1P84550 965 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 C2orf54Q08AI8 447 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SERINC3Q13530 473 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DGKDQ16760 1214 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PARM1Q6UWI2 310 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DAAM2Q86T65 1068 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HOOK3Q86VS8 718 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SLC30A5Q8TAD4 765 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 AUTS2Q8WXX7 1259 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SEC14L1Q92503 715 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GJA10Q969M2 543 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 EEF2KMTQ96G04 330 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KATNAL1Q9BW62 490 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GGA2Q9UJY4 613 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 BSNQ9UPA5 3926 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.57□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 A0A0U1RQJ8 604 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TMCO5BA8MYB1 307 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 H3BQF6 201 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 EML1O00423 815 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KRIT1O00522 736 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SRGAP2O75044 1071 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HIP1RO75146 1068 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RTN2O75298 545 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 LDHAP00338 332 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PSAPP07602 524 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MYZAPP0CAP1 466 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CHRNA3P32297 505 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 HOXD13P35453 343 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SLC1A1P43005 524 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 RARRES1P49788 294 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MXI1P50539 228 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CASP5P51878 434 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 GCNT1Q02742 428 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SLC20A2Q08357 652 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 LY6DQ14210 128 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 KRT39Q6A163 491 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 SLFN12LQ6IEE8 588 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 P3H4Q92791 437 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FAXDC2Q96IV6 333 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 IFT74Q96LB3 600 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FIZ1Q96SL8 496 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 NELL2Q99435 816 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 LRRC1Q9BTT6 524 aa8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
GGA3-218ENST00000584243 TMEM8AQ9HCN3 771 aa8.56□□□□□ -1.04
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