RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYADML2A6NDP7 307 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBOX5O94941 541 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAS8O95995 478 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKR1A1P14550 325 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATF2P15336 505 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MYO1EQ12965 1108 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GALNTL6Q49A17 601 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KATNAL2Q8IYT4 538 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP4X1Q8N118 509 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C7orf31Q8N865 590 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATL2Q8NHH9 583 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CKAP2Q8WWK9 683 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CPXM1Q96SM3 734 aa25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RECQL4O94761 1208 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PURAQ00577 322 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SREBF2Q12772 1141 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMYD5Q6GMV2 418 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRPV1Q8NER1 839 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANAPC5Q9UJX4 755 aa25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STAU1O95793 577 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHA2P01877 340 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RPAINQ86UA6 219 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOD2Q9HC29 1040 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SCN1AP35498 2009 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CFAP73A6NFT4 308 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADCY8P40145 1251 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAP1Q03518 808 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INCA1Q0VD86 236 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEP57Q86XR8 500 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DERAQ9Y315 318 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SNX9Q9Y5X1 595 aa25.29■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PI4K2BG5E9Z4 385 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VDRP11473 427 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCALDP61601 193 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD42Q8N9B4 389 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBA3Q8TBC4 463 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KLK14Q9P0G3 267 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DNAH12Q6ZR08 3092 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERBB2P04626 1255 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRAFP15056 766 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BEST2Q8NFU1 509 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EXD1Q8NHP7 514 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OSBPL8Q9BZF1 889 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNK9Q9NPC2 374 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GGT7Q9UJ14 662 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.28■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT3P12035 628 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AXLP30530 894 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC8A1P32418 973 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VPS41P49754 854 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RIPK1Q13546 671 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NUGGCQ68CJ6 796 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RELL1Q8IUW5 271 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPATCH11Q8N954 259 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 JOSD2Q8TAC2 188 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EURLQ9NYK6 297 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT1P04264 644 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCNG2Q16589 344 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XYLT1Q86Y38 959 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM118BQ9BPY3 351 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNTN3Q9P232 1028 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRKAG3Q9UGI9 489 aa25.27■■□□□ 1.64
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SUN1O94901 812 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNAT1P11488 350 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PSMA2P25787 234 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZBTB6Q15916 424 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNASQ5JWF2 1037 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C12orf29Q8N999 325 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF39Q9H2S5 420 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CXorf56Q9H5V9 222 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25.26■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HMGCRP04035 888 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP3A5P20815 502 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPD2P43304 727 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CGB2Q6NT52 195 aa25.25■■□□□ 1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALKAL1Q6UXT8 129 aa25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms