RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 CEP135Q66GS9 1140 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 SYNPOQ8N3V7 929 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 GCNT4Q9P109 453 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 RAB23Q9ULC3 237 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.33■■□□□ 1.17
PPP4C-211ENST00000567642 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 CLDN5O00501 218 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PDXKO00764 312 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 CALUO43852 315 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ABL1P00519 1130 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PRR29P0C7W0 189 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 RAP1GAPP47736 663 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 FNTBP49356 437 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PDE6CP51160 858 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 NCOA4Q13772 614 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF77Q15935 545 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 LPAL2Q16609 132 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PRR23BQ6ZRT6 265 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 CPA6Q8N4T0 437 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 C8orf48Q96LL4 319 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.32■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 DLG4P78352 724 aa22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 DMWDQ09019 674 aa22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 USP4Q13107 963 aa22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 FSTL4Q6MZW2 842 aa22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 MED10Q9BTT4 135 aa22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 GMEB2Q9UKD1 530 aa22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.31■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 KIF20AO95235 890 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 CACNA2D1P54289 1103 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 CLDN10P78369 228 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM196Q5HYL7 178 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 CHFRQ96EP1 664 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ECT2Q9H8V3 914 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 VRTNQ9H8Y1 702 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 FRYLO94915 3013 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ATP8B3O60423 1300 aa22.3■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 K7ESF4 209 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 VNN1O95497 513 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 EGFP01133 1207 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 GJA4P35212 333 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 GALK1P51570 392 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TAF10Q12962 218 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ATP2A3Q93084 1043 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 EXOC4Q96A65 974 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TNIP3Q96KP6 325 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa22.29■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 MYOFQ9NZM1 2061 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF840PA6NDX5 716 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 P4HA1P13674 534 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PPP3CCP48454 512 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 NR1H3Q13133 447 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 EML3Q32P44 896 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 LONP2Q86WA8 852 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TMC2Q8TDI7 906 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 RMDN1Q96DB5 314 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 SDCBP2Q9H190 292 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 GDPD2Q9HCC8 539 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa22.28■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PQ27 194 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PQ64 194 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 A0A1W2PQD8 194 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 ATG13O75143 517 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 RHOBTB3O94955 611 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 PFKLP17858 780 aa22.27■■□□□ 1.16
PPP4C-211ENST00000567642 DRD1P21728 446 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms