RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, human

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FOXN3-210	ENST00000555658		Q6ZRM9	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	IL23A	Q9NPF7	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	MYH7	P12883	1935 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ESYT2	A0FGR8	921 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FOXN1	O15353	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	VCAM1	P19320	739 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	BMP5	P22003	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FNTB	P49356	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	KIF11	P52732	1056 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	HMGCS2	P54868	508 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	PPIL2	Q13356	520 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	SNAPC2	Q13487	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	MOB2	Q70IA6	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	BLID	Q8IZY5	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	NME8	Q8N427	588 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	CUL5	Q93034	780 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	COA7	Q96BR5	231 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	C12orf42	Q96LP6	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	WDR92	Q96MX6	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	AGAP2	Q99490	1192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ACSS2	Q9NR19	701 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FIBP	O43427	364 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	FAM20B	O75063	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	YEATS4	O95619	227 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	BMP15	O95972	392 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ICAM1	P05362	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	JUN	P05412	331 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	CETP	P11597	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	TGM1	P22735	817 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ME1	P48163	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	NPEPPS	P55786	919 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	BCAR1	P56945	870 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	HUNK	P57058	714 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	SNAP25	P60880	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ACAP1	Q15027	740 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	STK38	Q15208	465 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ZNF174	Q15697	407 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	USH1G	Q495M9	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FOXN3-210	ENST00000555658	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.62	□□□□□ -1.67

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