RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	GIPC2	Q8TF65	315 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SNX19	Q92543	992 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	LENG9	Q96B70	501 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	TCTN2	Q96GX1	697 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	USP20	Q9Y2K6	914 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	CKAP5	Q14008	2032 aa		12.33	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	LARGE1	O95461	756 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ACP1	P24666	158 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	NR1H3	Q13133	447 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	VASH2	Q86V25	355 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	LRRC15	Q8TF66	581 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	DDX12P	Q92771	950 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	JMJD1C	Q15652	2540 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	LAD1	O00515	517 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	PODXL	O00592	558 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ITGAV	P06756	1048 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	TNFRSF4	P43489	277 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	POLE2	P56282	527 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	BNIP3	Q12983	259 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	MORC3	Q14149	939 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	CLEC14A	Q86T13	490 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	MON1A	Q86VX9	555 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	GCNA	Q96QF7	691 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM245	Q9H330	911 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	GDA	Q9Y2T3	454 aa		12.31	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	NFATC1	O95644	943 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	DDAH2	O95865	285 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	NTSR1	P30989	418 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	GRIA2	P42262	883 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ASIC1	P78348	528 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	PADI6	Q6TGC4	694 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ITIH5	Q86UX2	942 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SUSD3	Q96L08	255 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	CASS4	Q9NQ75	786 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		12.3	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	WASH3P	C4AMC7	463 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	WIPF1	O43516	503 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	EDIL3	O43854	480 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	OPA1	O60313	960 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	LDLR	P01130	860 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	EDN1	P05305	212 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ADRA1B	P35368	520 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	TPMT	P51580	245 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	REST	Q13127	1097 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	GPR17	Q13304	367 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	CAPS	Q13938	189 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	DHCR24	Q15392	516 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	UROC1	Q96N76	676 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	12.29	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	MYMK	A6NI61	221 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	WNT1	P04628	370 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ABCB4	P21439	1286 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	TEAD4	Q15561	434 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	PRR16	Q569H4	304 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	GABRG3	Q99928	467 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
ABCD4-222	ENST00000555617	MYH10	P35580	1976 aa		12.28	□□□□□ -0.44

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