RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554994.5

ATXN3-231, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 922 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-231	ENST00000554994	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	BMP7	P18075	431 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	CYP11B2	P19099	503 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	PLCG1	P19174	1290 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	GLRA2	P23416	452 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	GDNF	P39905	211 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	STAT6	P42226	847 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	MTHFR	P42898	656 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	CLCN7	P51798	805 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	PKP1	Q13835	747 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC39A14	Q15043	492 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	USP49	Q70CQ1	688 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SV2B	Q7L1I2	683 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF410	Q86VK4	478 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	GPBP1	Q86WP2	473 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	MYCT1	Q8N699	235 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	PJA1	Q8NG27	643 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	STAM	Q92783	540 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	LPP	Q93052	612 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	BICD1	Q96G01	975 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SPATA32	Q96LK8	384 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	AK8	Q96MA6	479 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	TMX1	Q9H3N1	280 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	RGS18	Q9NS28	235 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	RNF19A	Q9NV58	838 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	DACT1	Q9NYF0	836 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	WNT16	Q9UBV4	365 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	PARP2	Q9UGN5	583 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SPTA1	P02549	2419 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SLC16A4	O15374	487 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	CUTA	O60888	179 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	DGKI	O75912	1065 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	C1QL1	O75973	258 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	NPTXR	O95502	500 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ABL1	P00519	1130 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	RET	P07949	1114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ITGA4	P13612	1032 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	IDE	P14735	1019 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	MUT	P22033	750 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	DDIT3	P35638	169 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ARL2	P36404	184 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	PTEN	P60484	403 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	OSTN	P61366	133 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ITIH3	Q06033	890 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	STRN3	Q13033	797 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	CAPS	Q13938	189 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	PPP2R5A	Q15172	486 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	PTPA	Q15257	358 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	CSRP2	Q16527	193 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	MAPK6	Q16659	721 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	KCNK18	Q7Z418	384 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	THNSL1	Q8IYQ7	743 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ATXN3-231	ENST00000554994	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59

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