RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545698.1

TDG-210, Transcript of thymine DNA glycosylase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TDG, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDG-210ENST00000545698 SPATA17Q96L03 361 aa20.3■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 PANK2Q9BZ23 570 aa20.3■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 INTS13Q9NVM9 706 aa20.3■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 FRYQ5TBA9 3013 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 C4orf47A7E2U8 309 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 PDGFRBP09619 1106 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 PDCP20941 246 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 LMO2P25791 158 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 ANO7Q6IWH7 933 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 TTC30AQ86WT1 665 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 USP33Q8TEY7 942 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 MMS19Q96T76 1030 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 EHD2Q9NZN4 543 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.29■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 PTPRJQ12913 1337 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 ZNF233A6NK53 670 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 LEFTY2O00292 366 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 PFKLP17858 780 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 OPRD1P41143 372 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 SURF1Q15526 300 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 DUOXA2Q1HG44 320 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 PMS2CLQ68D20 193 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.28■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 LNP1A1A4G5 178 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 K7EQS6 105 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 TRIM66O15016 1216 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 ABL1P00519 1130 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 USP46P62068 366 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 PCED1BQ96HM7 432 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 SNX25Q9H3E2 840 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.27■□□□□ 0.84
TDG-210ENST00000545698 ALDH1A2O94788 518 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 PPP3CCP48454 512 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 ZXDBP98169 803 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 LIMS2Q7Z4I7 341 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 RASSF3Q86WH2 238 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 PDILTQ8N807 584 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 SMPD4Q9NXE4 827 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 CPQQ9Y646 472 aa20.26■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 F8VP50 259 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 CYP17A1P05093 508 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 BCKDHBP21953 392 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 SLC7A9P82251 487 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 RESTQ13127 1097 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 CRY1Q16526 586 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 WDR49Q8IV35 697 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 TMEM9BQ9NQ34 198 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.25■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 A0A087X0B3 334 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 ANTXRLA6NF34 631 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 GIPC1O14908 333 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 NOP14P78316 857 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 DHCR24Q15392 516 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 GAB4Q2WGN9 574 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 RNF38Q9H0F5 515 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 GON4LQ3T8J9 2241 aa20.24■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 CACNA1GO43497 2377 aa20.23■□□□□ 0.83
TDG-210ENST00000545698 PI4KAP42356 2102 aa20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms