RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 ZNF862O60290 1169 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ATP6V1G1O75348 118 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CD58P19256 250 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FDFT1P37268 417 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FOLH1Q04609 750 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 BTKQ06187 659 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TRIP10Q15642 601 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 WDR44Q5JSH3 913 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PADI6Q6TGC4 694 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TTC7BQ86TV6 843 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLC26A11Q86WA9 606 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 RHPN2Q8IUC4 686 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 KSR1Q8IVT5 923 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 NAT8LQ8N9F0 302 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FBXO36Q8NEA4 188 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLC26A7Q8TE54 656 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GMCL1Q96IK5 515 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 UIMC1Q96RL1 719 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 RIT2Q99578 217 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PCDH18Q9HCL0 1135 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CD209Q9NNX6 404 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CLIC5Q9NZA1 410 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TELO2Q9Y4R8 837 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 NR2E3Q9Y5X4 410 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MYPNQ86TC9 1320 aa11.29□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 VILLO15195 856 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CBFA2T3O75081 653 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CALB1P05937 261 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SHMT1P34896 483 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SERPINB6P35237 376 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CPA2P48052 419 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 NCKAP1LP55160 1127 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TAS2R40P59535 323 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MAMLD1Q13495 774 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 USP41Q3LFD5 358 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SFT2D3Q587I9 215 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 STXBP5Q5T5C0 1151 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 OLFML2BQ68BL8 750 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 POLNQ7Z5Q5 900 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TREML1Q86YW5 311 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 NUDCD3Q8IVD9 361 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 BIRC8Q96P09 236 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 ACAP3Q96P50 834 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SERPINI1Q99574 410 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 IKZF4Q9H2S9 585 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GINM1Q9NU53 330 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 THAP1Q9NVV9 213 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HSFX1Q9UBD0 423 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PLLPQ9Y342 182 aa11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 H3BNX3 289 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 KRT38O76015 456 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SMIM18P0DKX4 95 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SSTR1P30872 391 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CPOXP36551 454 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CD97P48960 835 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SERPINB9P50453 376 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 AQP5P55064 265 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 AQP4P55087 323 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 INHBCP55103 352 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 CREB5Q02930 508 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GRIK5Q16478 980 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 GRAMD1BQ3KR37 738 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 SLC44A4Q53GD3 710 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 FSCBQ5H9T9 825 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 KAZNQ674X7 775 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 PGM2L1Q6PCE3 622 aa11.27□□□□□ -0.6
LMO3-215ENST00000537304 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms