RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525861.5

ACER3-204, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-204ENST00000525861 SYT15Q9BQS2 421 aa24.42■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 CNPY3Q9BT09 278 aa24.42■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 DUSP16Q9BY84 665 aa24.42■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 LRRC19Q9H756 370 aa24.42■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 RNF8O76064 485 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 KRT7P08729 469 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 FLT3P36888 993 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 CUL1Q13616 776 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 GPNMBQ14956 572 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 MDH1BQ5I0G3 518 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 CLLU1OSQ5K130 101 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 TRNP1Q6NT89 227 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 TTC27Q6P3X3 843 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 CRTAC1Q9NQ79 661 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 KLHL11Q9NVR0 708 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 NFU1Q9UMS0 254 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 CYP11A1P05108 521 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PDGFRAP16234 1089 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 SCNN1AP37088 669 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 COILP38432 576 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 SLC8A3P57103 927 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 COPS2P61201 443 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PLCB3Q01970 1234 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 TRADDQ15628 312 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 B3GNT5Q9BYG0 378 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 RAB17Q9H0T7 212 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 CDH9Q9ULB4 789 aa24.41■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 TSC2P49815 1807 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 M0QZQ0 153 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 NPR3P17342 541 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PCSK1P29120 753 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PCK1P35558 622 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 ODF2Q5BJF6 829 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 JAMLQ86YT9 394 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP24.4■■□□□ 1.58e-6■■■□□ 18.5
ACER3-204ENST00000525861 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 WBP1LQ9NX94 342 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 OGFRQ9NZT2 677 aa24.4■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PI4K2BG5E9Z4 385 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 CLDN5O00501 218 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 DPYSL4O14531 572 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 GRAP2O75791 330 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 COL6A1P12109 1028 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 IL1R2P27930 398 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PTPN7P35236 360 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 PTGIRP43119 386 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 BRCC3P46736 316 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 MFSD7Q6UXD7 560 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 URGCPQ8TCY9 931 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 TMEM161AQ9NX61 479 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 RASAL2Q9UJF2 1139 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 DSEQ9UL01 958 aa24.39■■□□□ 1.5
ACER3-204ENST00000525861 I3L4J1 428 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 MIPP30301 263 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 DSC1Q08554 894 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 TAF5Q15542 800 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 SLC26A9Q7LBE3 791 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 PIGZQ86VD9 579 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 METTL23Q86XA0 190 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 RSPH1Q8WYR4 309 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 RAPGEF5Q92565 580 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 CAVIN3Q969G5 261 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 MED10Q9BTT4 135 aa24.39■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 CCDC105Q8IYK2 499 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 HASPINQ8TF76 798 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 C1orf54Q8WWF1 131 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 ERP44Q9BS26 406 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 ZWILCHQ9H900 591 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 HOMER3Q9NSC5 361 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 KANSL3Q9P2N6 904 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 LRRD1A4D1F6 860 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 LCP1P13796 627 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 NNTQ13423 1086 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 TFDP3Q5H9I0 405 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 CLEC20AQ6ZU45 233 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 ARCQ7LC44 396 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 SUSD3Q96L08 255 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 FAM114A2Q9NRY5 505 aa24.38■■□□□ 1.49
ACER3-204ENST00000525861 USP18Q9UMW8 372 aa24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms