RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 MYO9BQ13459 2157 aa24.02■■□□□ 1.44
TSNARE1-208ENST00000524325 EPCAMP16422 314 aa24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 NRIP1P48552 1158 aa24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 CREMQ03060 361 aa24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PDCLQ13371 301 aa24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 FEZF2Q8TBJ5 459 aa24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 GIPC2Q8TF65 315 aa24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 C11orf70Q9BRQ4 267 aa24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 NENFQ9UMX5 172 aa24.02■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PRRG1O14668 218 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP6O43182 974 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCB4P21439 1286 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 CLCN4P51793 760 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 LILRA6Q6PI73 481 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SPPL2BQ8TCT7 592 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 TLE6Q9H808 572 aa24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 REV3LO60673 3130 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 HHLA1C9JL84 531 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 LSM8O95777 96 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ERBB2P04626 1255 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 LCP1P13796 627 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 NSFP46459 744 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 MTMR3Q13615 1198 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 TPGS2Q68CL5 300 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SMYD5Q6GMV2 418 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM72Q6ZMU5 477 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SCAMP5Q8TAC9 235 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 IGFLR1Q9H665 355 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 EYSQ5T1H1 3165 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ATP8B3O60423 1300 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 E5RJQ4 531 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 GLUD1P00367 558 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ATF6P18850 670 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ELF1P32519 619 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 CENPCQ03188 943 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRE1Q14246 886 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 MIS12Q9H081 205 aa24■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SETSIPP0DME0 302 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 Q7L0L9 218 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ERICH1Q86X53 443 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 KREMEN2Q8NCW0 462 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 LMAN2LQ9H0V9 348 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCB6Q9NP58 842 aa23.99■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 RCCD1A6NED2 376 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 GJB6O95452 261 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PLA2G4AP47712 749 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC8A3P57103 927 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SMARCB1Q12824 385 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SPA17Q15506 151 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PTPROQ16827 1216 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 VSTM1Q6UX27 236 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SYNCQ9H7C4 482 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ADAM22Q9P0K1 906 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 YIPF1Q9Y548 306 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 RTN2O75298 545 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEA1P43355 309 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 MAGEA11P43364 429 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 GALCP54803 685 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 USP46P62068 366 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ADIGQ0VDE8 80 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 TWF1Q12792 350 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PTP4A2Q12974 167 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 MON1BQ7L1V2 547 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 THAP2Q9H0W7 228 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ISCUQ9H1K1 167 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.98■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 NRDCO43847 1150 aa23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 RFPL2O75678 378 aa23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 LCA5LO95447 670 aa23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 GZMAP12544 262 aa23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 MMP8P22894 467 aa23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 TCEAL5Q5H9L2 206 aa23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 MCOLN2Q8IZK6 566 aa23.97■■□□□ 1.43
TSNARE1-208ENST00000524325 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms