RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518963.5

PSD3-208, Transcript of pleckstrin and Sec7 domain containing 3, human

TSL 2

Gene PSD3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSD3-208	ENST00000518963	HGF	P14210	728 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	KRT4	P19013	534 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	EEF1G	P26641	437 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	GABRB3	P28472	473 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	LRPAP1	P30533	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ACVRL1	P37023	503 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	GDF5	P43026	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	PRKAG1	P54619	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	STK3	Q13188	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ICE2	Q659A1	982 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	CRB3	Q9BUF7	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	AREL1	O15033	823 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	YY2	O15391	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	PROM1	O43490	865 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	SLPI	P03973	132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	CHRM2	P08172	466 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	MYL4	P12829	197 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	C6	P13671	934 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	TPH1	P17752	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	TACR2	P21452	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	NTSR1	P30989	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	LIPA	P38571	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	CLCN2	P51788	898 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	MAPK10	P53779	464 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	FOXI1	Q12951	378 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	E2F2	Q14209	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	INSC	Q1MX18	579 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	GGT6	Q6P531	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963		Q6YL49	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	TFAP2B	Q92481	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	MRI	Q9BWK5	157 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963		A0A087WV62	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	RGS10	O43665	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	PLA2G6	O60733	806 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	PIAS2	O75928	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	MAK	P20794	623 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ATIC	P31939	592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	PLA2G5	P39877	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	MPL	P40238	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	FHL3	Q13643	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	PTPA	Q15257	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963		Q6ZNX1	250 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	GLG1	Q92896	1179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	RFK	Q969G6	155 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	FBXL20	Q96IG2	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PSD3-208	ENST00000518963	NELL2	Q99435	816 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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