RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 PKP2Q99959 881 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPOCK3Q9BQ16 436 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRCC1Q9C099 1032 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 OSBPL2Q9H1P3 480 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATXN3LQ9H3M9 355 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARMT1Q9H993 441 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CYP4F11Q9HBI6 524 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP29Q9HBJ7 922 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBN1Q9NPG3 1134 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLAMF7Q9NQ25 335 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 COPRSQ9NQ92 184 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GKN1Q9NS71 199 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM105AQ9NUU6 356 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MARCH5Q9NX47 278 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADGRE2Q9UHX3 823 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HELZP42694 1942 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CEP192Q8TEP8 1941 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF532Q9HCE3 1301 aa2.15□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ESPL1Q14674 2120 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1B0GUH1 482 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANTXRLA6NF34 631 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYMKA6NI61 221 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TSPY2A6NKD2 308 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 BTBD18B2RXH4 712 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SGK1O00141 431 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 OPLAHO14841 1288 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 BACH1O14867 736 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 NKX2-8O15522 239 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PROM1O43490 865 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MARCH6O60337 910 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HBP1O60381 514 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRDM1O75626 825 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 BCAR3O75815 825 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MBD4O95243 580 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATG7O95352 703 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGF19O95750 216 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARAFP10398 606 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ITGA4P13612 1032 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXB2P14652 356 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TYRP1P17643 537 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHMLP26374 656 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD6P30203 668 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GJA4P35212 333 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 AVPR1AP37288 418 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRIK1P39086 918 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFNAR2P48551 515 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TDO2P48775 406 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC26A2P50443 739 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARPP19P56211 112 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CSNK1G2P78368 415 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TFAP4Q01664 338 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 Q0VFX4 171 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RESTQ13127 1097 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PLD1Q13393 1074 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB33AQ14088 237 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDGFRLQ15198 375 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TAF12Q16514 161 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNT1Q5JUK3 1230 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RTP2Q5QGT7 225 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 EMC10Q5UCC4 262 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DCAF12L1Q5VU92 463 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRIM68Q6AZZ1 485 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTBK2Q6IQ55 1244 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 NUDT18Q6ZVK8 323 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRGPRGQ86SM5 289 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCHSD1Q86WN1 690 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFAND4Q86XD8 727 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CKAP2LQ8IYA6 745 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 COLGALT2Q8IYK4 626 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 HS6ST3Q8IZP7 471 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SAP25Q8TEE9 199 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GRAMD1AQ96CP6 724 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 CDHR1Q96JP9 859 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SENP7Q9BQF6 1050 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM121Q9BTD3 319 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR174Q9BXC1 333 aa2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR62Q9BZJ7 368 aa2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms