RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 TNFRSF10BO14763 440 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CCL16O15467 120 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CSH1P0DML2 217 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CSH2P0DML3 217 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 KRT9P35527 623 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 PLA2G4AP47712 749 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 MAP3K7CLP57077 242 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CDR2Q01850 454 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 PDE4CQ08493 712 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 ASIC2Q16515 512 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 ELMOD1Q8N336 334 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 COMMD8Q9NX08 183 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CD207Q9UJ71 328 aa22.38■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 MFAP3LO75121 409 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 GPD2P43304 727 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 MRE11P49959 708 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 EPHA5P54756 1037 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 ARID5AQ03989 594 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 EP400NLQ6ZTU2 488 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CNGA4Q8IV77 575 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 DRC7Q8IY82 874 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 LEMD2Q8NC56 503 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 OR8K1Q8NGG5 319 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 STK32AQ8WU08 396 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 KCTD13Q8WZ19 329 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 MYRFLQ96LU7 910 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SYT11Q9BT88 431 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 IL37Q9NZH6 218 aa22.37■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CFHP08603 1231 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 PTPN2P17706 415 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CHRNB2P17787 502 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 GSE1Q14687 1217 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 RAB41Q5JT25 222 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CES5AQ6NT32 575 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 PIGZQ86VD9 579 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 NUP93Q8N1F7 819 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 UBA3Q8TBC4 463 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 GIPC2Q8TF65 315 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 HSFY1Q96LI6 401 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 LRRC3Q9BY71 257 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 EHD2Q9NZN4 543 aa22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 KCNA5P22460 613 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 FMO1Q01740 532 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 LEXMQ3ZCV2 418 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 HGSNATQ68CP4 663 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 GPR152Q8TDT2 470 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SUSD6Q92537 303 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 AGPAT1Q99943 283 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CYLDQ9NQC7 956 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 PATJQ8NI35 1801 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 FAM92AA1XBS5 289 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 TULP2O00295 520 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SERPING1P05155 500 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 MMEP08473 750 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 MTHFRP42898 656 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SLC5A3P53794 718 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 TAF3Q5VWG9 929 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 TMC8Q8IU68 726 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 WDTC1Q8N5D0 677 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 PIDD1Q9HB75 910 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 ABHD10Q9NUJ1 306 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 CEP83Q9Y592 693 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 USP3Q9Y6I4 520 aa22.34■■□□□ 1.17
ACTN3-202ENST00000511191 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms