RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507186.1

RHOBTB3-208, Transcript of Rho related BTB domain containing 3, human

TSL 3

Gene RHOBTB3, Length 492 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RPS6KB1	P23443	525 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	YY1	P25490	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	KRT20	P35900	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ADAM8	P78325	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	IQCB1	Q15051	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NPY5R	Q15761	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TBR1	Q16650	682 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NFRKB	Q6P4R8	1299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TSPYL6	Q8N831	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MED15	Q96RN5	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SPATA25	Q9BR10	227 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SGPP1	Q9BX95	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NR2E1	Q9Y466	385 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	UBE2QL1	A1L167	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	STC2	O76061	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NTSR2	O95665	410 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	FDXR	P22570	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	GLDC	P23378	1020 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SLC5A2	P31639	672 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RAD52	P43351	418 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PRKAG1	P54619	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	LILRA4	P59901	499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	HGFAC	Q04756	655 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ANKRD1	Q15327	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CCNG2	Q16589	344 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ATG16L1	Q676U5	607 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SMO	Q99835	787 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	GPR34	Q9UPC5	381 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186		A0A1W2PRX2	142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	DCLK1	O15075	740 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PEX10	O60683	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	AR	P10275	920 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	SERPINA4	P29622	427 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	PIGF	Q07326	219 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RHOBTB3-208	ENST00000507186	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms