RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496015.5

ABCD4-217, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,248 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-217ENST00000496015 RUBCNQ92622 972 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TAF4BQ92750 862 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa14.52□□□□□ -0.08
ABCD4-217ENST00000496015 F8VP50 259 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 MAPK13O15264 365 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 KRT13P13646 458 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NUCB2P80303 420 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DPYDQ12882 1025 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 MTF1Q14872 753 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CPA6Q8N4T0 437 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ZBTB44Q8NCP5 570 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NELL1Q92832 810 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ATP2A3Q93084 1043 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 MED10Q9BTT4 135 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DNAI2Q9GZS0 605 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 EBF3Q9H4W6 596 aa14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TADA3O75528 432 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ABL1P00519 1130 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 PRR29P0C7W0 189 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NR2F2P24468 414 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 PIK3CAP42336 1068 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 IFNAR2P48551 515 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 VAMP7P51809 220 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DLG4P78352 724 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NR1H3Q13133 447 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NFIL3Q16649 462 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ZACNQ401N2 412 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SV2AQ7L0J3 742 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 RMND1Q9NWS8 449 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NCDNQ9UBB6 729 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 RAB23Q9ULC3 237 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.51□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 C2orf78A6NCI8 922 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 LILRB5O75023 590 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ATG13O75143 517 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CDH8P55286 799 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ENPEPQ07075 957 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ADAM9Q13443 819 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CCINQ13939 588 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF77Q15935 545 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TRIM68Q6AZZ1 485 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 NUP93Q8N1F7 819 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SLC22A12Q96S37 553 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 EPC1Q9H2F5 836 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 HPS4Q9NQG7 708 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GCNT4Q9P109 453 aa14.5□□□□□ -0.09
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ABCD4-217ENST00000496015 NME7Q9Y5B8 376 aa14.5□□□□□ -0.09
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ABCD4-217ENST00000496015 FRYLO94915 3013 aa14.5□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 CLDN5O00501 218 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 VNN1O95497 513 aa14.49□□□□□ -0.09
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ABCD4-217ENST00000496015 TCF3P15923 654 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 YWHAQP27348 245 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 RAP1GAPP47736 663 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 USP46P62068 366 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SATB1Q01826 763 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 TAF10Q12962 218 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 USP4Q13107 963 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 UNC93AQ86WB7 457 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 KIAA1958Q8N8K9 716 aa14.49□□□□□ -0.09
ABCD4-217ENST00000496015 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.49□□□□□ -0.09
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