RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492164.5

TIMMDC1-206, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TIMMDC1, Length 725 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-206ENST00000492164 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 VPS45Q9NRW7 570 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa13.13□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ANTXRLA6NF34 631 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TM4SF5O14894 197 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 NFATC1O95644 943 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TCF3P15923 654 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 WARSP23381 471 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ANXA13P27216 316 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 GBP1P32455 592 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 PDE6CP51160 858 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 DGKEP52429 567 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ZXDBP98169 803 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CREB5Q02930 508 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 NR1H3Q13133 447 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 SURF1Q15526 300 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 DUOXA2Q1HG44 320 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 MDH1BQ5I0G3 518 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 VSTM1Q6UX27 236 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 WDR49Q8IV35 697 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TSTD1Q8NFU3 115 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 PCED1BQ96HM7 432 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 MMS19Q96T76 1030 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TPSD1Q9BZJ3 242 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 EBF1Q9UH73 591 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 INVSQ9Y283 1065 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 PI4KAP42356 2102 aa13.12□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 F8VP50 259 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 LEFTY2O00292 366 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TRIM66O15016 1216 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 RHOBTB1O94844 696 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 DLATP10515 647 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 PMLP29590 882 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 HOXD13P35453 343 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 OPRD1P41143 372 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 GAB4Q2WGN9 574 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 C2orf27AQ580R0 203 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 RNF43Q68DV7 783 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 USP33Q8TEY7 942 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 EDEM2Q9BV94 578 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TNMDQ9H2S6 317 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 FOXD4L1Q9NU39 408 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 SMPD4Q9NXE4 827 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 MTMR6Q9Y217 621 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 NME7Q9Y5B8 376 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CHD6Q8TD26 2715 aa13.11□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ZNF840PA6NDX5 716 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 K7EQS6 105 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ABL1P00519 1130 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CYP17A1P05093 508 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 NASPP49321 788 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CACNA2D1P54289 1103 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ASIC1P78348 528 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 STK38Q15208 465 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ANO7Q6IWH7 933 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CCDC33Q8N5R6 958 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 RDH13Q8NBN7 331 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 OR6B3Q8NGW1 331 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CCDC127Q96BQ5 260 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CEP295NLQ96MC4 621 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TTLL2Q9BWV7 592 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TRIM9Q9C026 710 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 RNF38Q9H0F5 515 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 SNX25Q9H3E2 840 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CPQQ9Y646 472 aa13.1□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 KCNK5O95279 499 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CAVIN2O95810 425 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CST3P01034 146 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 PFKLP17858 780 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TNNI1P19237 187 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 BCKDHBP21953 392 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 CYP2J2P51589 502 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 TNNC1P63316 161 aa13.09□□□□□ -0.31
TIMMDC1-206ENST00000492164 NOP14P78316 857 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms