RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
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PTPN4-211ENST00000488279 K7ESF4 209 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN4-211ENST00000488279 PDXKO00764 312 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN4-211ENST00000488279 CLSTN1O94985 981 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN4-211ENST00000488279 PFKLP17858 780 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN4-211ENST00000488279 CNR2P34972 360 aa24.08■■□□□ 1.45
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PTPN4-211ENST00000488279 PPP3CCP48454 512 aa24.08■■□□□ 1.45
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PTPN4-211ENST00000488279 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.08■■□□□ 1.45
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PTPN4-211ENST00000488279 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.08■■□□□ 1.45
PTPN4-211ENST00000488279 KCTD10Q9H3F6 313 aa24.08■■□□□ 1.45
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PTPN4-211ENST00000488279 C2orf42Q9NWW7 574 aa24.07■■□□□ 1.44
PTPN4-211ENST00000488279 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.07■■□□□ 1.44
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PTPN4-211ENST00000488279 SLITRK1Q96PX8 696 aa24.05■■□□□ 1.44
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PTPN4-211ENST00000488279 RNF40O75150 1001 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPN4-211ENST00000488279 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
PTPN4-211ENST00000488279 RETP07949 1114 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPN4-211ENST00000488279 SDHBP21912 280 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPN4-211ENST00000488279 YWHAQP27348 245 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPN4-211ENST00000488279 RAP1GAPP47736 663 aa24.02■■□□□ 1.44
PTPN4-211ENST00000488279 ZXDBP98169 803 aa24.02■■□□□ 1.44
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