RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 USP17L7P0C7H9 530 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PFKFB1P16118 471 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 WARSP23381 471 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GRIK1P39086 918 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MAGEA11P43364 429 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP8P85298 464 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CYP24A1Q07973 514 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 USP4Q13107 963 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MDH1BQ5I0G3 518 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DPH6Q7L8W6 267 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SPATA18Q8TC71 538 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SCFD1Q8WVM8 642 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PCED1BQ96HM7 432 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 HHIPQ96QV1 700 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 P2RY13Q9BPV8 354 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 C7orf25Q9BPX7 421 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SLC39A2Q9NP94 309 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 HPSEQ9Y251 543 aa13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 A0A1B0GVL5 298 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SOBPA7XYQ1 873 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CLDN5O00501 218 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 HDCP19113 662 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 TNNI1P19237 187 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 HOXA6P31267 233 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CNR2P34972 360 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 AFMP43652 599 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 IFNAR2P48551 515 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CASP4P49662 377 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 AMPD3Q01432 767 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 EHHADHQ08426 723 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CUL4BQ13620 913 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PSMD6Q15008 389 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PDGFRLQ15198 375 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SURF1Q15526 300 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 EML3Q32P44 896 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CNNM4Q6P4Q7 775 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PRR23CQ6ZRP0 262 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 KBTBD6Q86V97 674 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CPA6Q8N4T0 437 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 IQUBQ8NA54 791 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ENGASEQ8NFI3 743 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 OR6B3Q8NGW1 331 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHO2Q8TD55 490 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 OSCP1Q8WVF1 389 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SPATA17Q96L03 361 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CGRRF1Q99675 332 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LRRC27Q9C0I9 530 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CUEDC2Q9H467 287 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SLC8A2Q9UPR5 921 aa13.48□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 F8VP50 259 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MBD3O95983 291 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SDHBP21912 280 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 NDUFA8P51970 172 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MYL6P60660 151 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 KCNB1Q14721 858 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CSRP2Q16527 193 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 WDR72Q3MJ13 1102 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 UNC13DQ70J99 1090 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 HS2ST1Q7LGA3 356 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 XXYLT1Q8NBI6 393 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 GAB3Q8WWW8 586 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CD101Q93033 1021 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FNBP1Q96RU3 617 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RTKNQ9BST9 563 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RNF38Q9H0F5 515 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SNX25Q9H3E2 840 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SMOC1Q9H4F8 434 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RXFP3Q9NSD7 469 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FAM13BQ9NYF5 915 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 MYOFQ9NZM1 2061 aa13.47□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LEFTY2O00292 366 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DCLK1O15075 740 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 LRP3O75074 770 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RPP40O75818 363 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ABL1P00519 1130 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CCDC192P0DO97 292 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DRD1P21728 446 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 RAP1GAPP47736 663 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 CDH8P55286 799 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 PSMD2Q13200 908 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 VSTM1Q6UX27 236 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 SFTPA1Q8IWL2 248 aa13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
PRAME-212ENST00000485532 ATP2A3Q93084 1043 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms