RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.49■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 ATP8B3O60423 1300 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 C2orf78A6NCI8 922 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 HRO43593 1189 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 HOXA6P31267 233 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 GJA4P35212 333 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 GALK1P51570 392 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 MYL6P60660 151 aa21.48■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 CD101Q93033 1021 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 C8orf48Q96LL4 319 aa21.48■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.48■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 MED10Q9BTT4 135 aa21.47■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 RNF40O75150 1001 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 RIN3Q8TB24 985 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-212ENST00000484841 TNIP3Q96KP6 325 aa21.46■■□□□ 1.03
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ACTB-212ENST00000484841 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.45■■□□□ 1.02
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ACTB-212ENST00000484841 C2orf42Q9NWW7 574 aa21.45■■□□□ 1.02
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ACTB-212ENST00000484841 LEFTY2O00292 366 aa21.44■■□□□ 1.02
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ACTB-212ENST00000484841 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.44■■□□□ 1.02
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ACTB-212ENST00000484841 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.44■■□□□ 1.02
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ACTB-212ENST00000484841 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 CEP135Q66GS9 1140 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 PKN3Q6P5Z2 889 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.022e-24■□□□□ 9.3
ACTB-212ENST00000484841 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-212ENST00000484841 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.43■■□□□ 1.02
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