RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, human

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NISCH-208	ENST00000481211	NCK2	O43639	380 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	FBXO21	O94952	628 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	VNN2	O95498	520 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	POU2F2	P09086	479 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	MMP8	P22894	467 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CYP2F1	P24903	491 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	HOXA9	P31269	272 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	GABRB2	P47870	512 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ALDH1A3	P47895	512 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	MAP3K7CL	P57077	242 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	DUSP4	Q13115	394 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PDCL	Q13371	301 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	DUSP6	Q16828	381 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ERICH1	Q86X53	443 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PASD1	Q8IV76	773 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	UBA3	Q8TBC4	463 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SMO	Q99835	787 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	TLE6	Q9H808	572 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CALCA	P01258	141 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SCNN1A	P37088	669 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	NAA35	Q5VZE5	725 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PIGZ	Q86VD9	579 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	C18orf8	Q96DM3	657 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	LRRC4	Q9HBW1	653 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	YIPF1	Q9Y548	306 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211		F8VP50	259 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PAPLN	O95428	1278 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CFH	P08603	1231 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CCDC175	P0C221	793 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CSH1	P0DML2	217 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CSH2	P0DML3	217 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	EPHB3	P54753	998 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PMF1	Q6P1K2	205 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ELMOD1	Q8N336	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	CASP10	Q92851	521 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	SPTLC3	Q9NUV7	552 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	IL37	Q9NZH6	218 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	NCAN	O14594	1321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	FAM92A	A1XBS5	289 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NISCH-208	ENST00000481211	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.73	□□□□□ -0.21

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