RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 RBP5P82980 135 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MYL7Q01449 175 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CREB5Q02930 508 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 E2F4Q16254 413 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 C2orf27AQ580R0 203 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 RRAGBQ5VZM2 374 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PMS2CLQ68D20 193 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 IL31Q6EBC2 164 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SV2BQ7L1I2 683 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 BRAPQ7Z569 592 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CPA6Q8N4T0 437 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MDGA1Q8NFP4 955 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 RASSF8Q8NHQ8 419 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 RLN3Q8WXF3 142 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PCED1BQ96HM7 432 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 FNBP1Q96RU3 617 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TTLL2Q9BWV7 592 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TRIM9Q9C026 710 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 VPS45Q9NRW7 570 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TMEM74BQ9NUR3 256 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 STK17AQ9UEE5 414 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ZMYM5Q9UJ78 669 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ITGA11Q9UKX5 1188 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 KIF3AQ9Y496 699 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 FAM208BQ5VWN6 2430 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 F8VP50 259 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SGK1O00141 431 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CLDN5O00501 218 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ADAM23O75077 832 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CAVIN2O95810 425 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 BMP15O95972 392 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 OAS1P00973 400 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 IDEP14735 1019 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 GAP43P17677 238 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CASP1P29466 404 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 IFNAR2P48551 515 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 LHX1P48742 406 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 DGKEP52429 567 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 IRX4P78413 519 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PSMD2Q13200 908 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 RNF43Q68DV7 783 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ANO7Q6IWH7 933 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 RHBDF2Q6PJF5 856 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PAQR9Q6ZVX9 377 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 GPD1LQ8N335 351 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 HPDLQ96IR7 371 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SPATA17Q96L03 361 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 EDEM2Q9BV94 578 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 B3GNT5Q9BYG0 378 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 FSCN3Q9NQT6 498 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PANK4Q9NVE7 773 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MTMR6Q9Y217 621 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ATRXP46100 2492 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SYT1P21579 422 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SLC7A9P82251 487 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 DHCR24Q15392 516 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MAP7D1Q3KQU3 841 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 FBXO43Q4G163 708 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MDH1BQ5I0G3 518 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MIB1Q86YT6 1006 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ALLCQ8N6M5 410 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PDILTQ8N807 584 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 IL17RCQ8NAC3 791 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SPATA18Q8TC71 538 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 ATP2A3Q93084 1043 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CHAMP1Q96JM3 812 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SDCBP2Q9H190 292 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 XYLT2Q9H1B5 865 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 SMPD4Q9NXE4 827 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CDH9Q9ULB4 789 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 CPQQ9Y646 472 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 NUP205Q92621 2012 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-206ENST00000474188 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
NISCH-206ENST00000474188 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms