RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 NME7Q9Y5B8 376 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SGK1O00141 431 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PIRO00625 290 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 NDC80O14777 642 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SNX16P57768 344 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 GPS1Q13098 491 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 KYNUQ16719 465 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 UBXN11Q5T124 520 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 MFSD5Q6N075 450 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RGMBQ6NW40 437 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PMF1Q6P1K2 205 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RELL1Q8IUW5 271 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ACTL9Q8TC94 416 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM121Q9BTD3 319 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ADAM7Q9H2U9 754 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PCDH9Q9HC56 1237 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.01■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 A8MXQ7 604 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 IGHA2P01877 340 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CD48P09326 243 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ETS1P14921 441 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 KCNE1P15382 129 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PNPLA4P41247 253 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PURAQ00577 322 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 AUHQ13825 339 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ARHGAP17Q68EM7 881 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RFX6Q8HWS3 928 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SLC4A5Q9BY07 1137 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TULP2O00295 520 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 AKR1A1P14550 325 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 INHBEP58166 350 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TAF5Q15542 800 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 XKR4Q5GH76 650 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TRNP1Q6NT89 227 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CHADLQ6NUI6 762 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 OLFML1Q6UWY5 402 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SESTD1Q86VW0 696 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SLC35F5Q8WV83 523 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CALN1Q9BXU9 219 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RNF39Q9H2S5 420 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RSAD1Q9HA92 442 aa18■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 KPNA7A9QM74 516 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 E7EVH7 732 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 EBAG9O00559 213 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 GRAP2O75791 330 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 HOXC8P31273 242 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PPARDQ03181 441 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 LONRF1Q17RB8 773 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM110Q86TL2 294 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 NLRP14Q86W24 1093 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 STK32AQ8WU08 396 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SERPINB12Q96P63 405 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PEBP4Q96S96 227 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 DNAI2Q9GZS0 605 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 DPEP3Q9H4B8 488 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 IPPQ9Y573 584 aa17.99■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 DPYSL4O14531 572 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PRPSAP2O60256 369 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 IFNB1P01574 187 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PSMC4P43686 418 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 MMP13P45452 471 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SEC24CP53992 1094 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SLC6A3Q01959 620 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 MORF4L2Q15014 288 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CDO1Q16878 200 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SAPCD2Q86UD0 394 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SELENOSQ9BQE4 189 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 GDAP2Q9NXN4 497 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 APOC2P02655 101 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 DESP17661 470 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TAF6P49848 677 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 PDE4CQ08493 712 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SV2CQ496J9 727 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TAF2Q6P1X5 1199 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TAOK1Q7L7X3 1001 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SNX25Q9H3E2 840 aa17.98■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 MAGEA4P43358 317 aa17.97■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CDH6P55285 790 aa17.97■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 CCDC14Q49A88 953 aa17.97■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
FAAP20-211ENST00000469733 SCUBE3Q8IX30 993 aa17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms