RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467987.1

ESRRA-204, Transcript of estrogen related receptor alpha, humanhuman

TSL 3

Gene ESRRA, Length 610 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRA-204ENST00000467987 KIF20AO95235 890 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ARSAP15289 507 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 HDCP19113 662 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 CDH8P55286 799 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 DLG4P78352 724 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 DPYDQ12882 1025 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 CEP135Q66GS9 1140 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 KRBA2Q6ZNG9 492 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SYNPOQ8N3V7 929 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 TTC16Q8NEE8 873 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 TTLL2Q9BWV7 592 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ELOVL4Q9GZR5 314 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 EPC1Q9H2F5 836 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SMYD3Q9H7B4 428 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa29.06■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 VNN1O95497 513 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 NOP14P78316 857 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 AMPD2Q01433 879 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 KCNB1Q14721 858 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ZNF77Q15935 545 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 DCLK2Q8N568 766 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 TMC2Q8TDI7 906 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 B3GNT5Q9BYG0 378 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SPTBN4Q9H254 2564 aa29.05■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 FRYLO94915 3013 aa29.04■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 PDE6CP51160 858 aa29.04■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 CACNA2D1P54289 1103 aa29.04■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 KIAA2013Q8IYS2 634 aa29.04■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 OSCP1Q8WVF1 389 aa29.04■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ELMO3Q96BJ8 720 aa29.04■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa29.04■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 HELZP42694 1942 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 CLDN5O00501 218 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 PFKLP17858 780 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 RAP1GAPP47736 663 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 PPP3CCP48454 512 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 USP4Q13107 963 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ZACNQ401N2 412 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 TMEM196Q5HYL7 178 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SH3RF2Q8TEC5 729 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 CHFRQ96EP1 664 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 GDPD2Q9HCC8 539 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 TMEM30AQ9NV96 361 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 NCDNQ9UBB6 729 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa29.03■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 IKBKBO14920 756 aa29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ZNF202O95125 648 aa29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 IFNAR2P48551 515 aa29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SV2AQ7L0J3 742 aa29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 CPA6Q8N4T0 437 aa29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 SDCBP2Q9H190 292 aa29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ECT2Q9H8V3 914 aa29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 WNT6Q9Y6F9 365 aa29.02■■■□□ 2.24
ESRRA-204ENST00000467987 ZNF840PA6NDX5 716 aa29.01■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 P4HA1P13674 534 aa29.01■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 TCF3P15923 654 aa29.01■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 NFIL3Q16649 462 aa29.01■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 FSTL4Q6MZW2 842 aa29.01■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 TNIP3Q96KP6 325 aa29.01■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 ATP8B3O60423 1300 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 K7ESF4 209 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 MAPK13O15264 365 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 NR2F2P24468 414 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 GJA4P35212 333 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 ID4P47928 161 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 VAMP7P51809 220 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 TAF10Q12962 218 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 C1orf220Q5T0J3 134 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 TAF4BQ92750 862 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 ATP2A3Q93084 1043 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 MED10Q9BTT4 135 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 C2orf42Q9NWW7 574 aa29■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 GPR179Q6PRD1 2367 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 ABL1P00519 1130 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 FNTBP49356 437 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 GALK1P51570 392 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 DMWDQ09019 674 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 EML3Q32P44 896 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 NUP93Q8N1F7 819 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 EXOC4Q96A65 974 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 SLITRK1Q96PX8 696 aa28.99■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 ATG2BQ96BY7 2078 aa28.98■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 AKAP3O75969 853 aa28.98■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 ZXDBP98169 803 aa28.98■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
ESRRA-204ENST00000467987 PAQR9Q6ZVX9 377 aa28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms