RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436200.2

CCDC18-AS1-210, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 492 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SKAP1Q86WV1 359 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SPICE1Q8N0Z3 855 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MPP5Q8N3R9 675 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PGBD1Q96JS3 809 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ACTRT3Q9BYD9 372 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LRIT1Q9P2V4 623 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.53□□□□□ -1.68
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 KAT6BQ8WYB5 2073 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TMEM233B4DJY2 109 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NPHP1O15259 732 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RHOP08100 348 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MYL3P08590 195 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CYP2C9P11712 490 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MYF5P13349 255 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TYRP1P17643 537 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LOXL3P58215 753 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NXPH1P58417 271 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FMO1Q01740 532 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 COL10A1Q03692 680 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SEMA5AQ13591 1074 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RAB32Q13637 225 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CNGA2Q16280 664 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SLC44A4Q53GD3 710 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ARMC3Q5W041 872 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 KIAA0895LQ68EN5 471 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ACTRT2Q8TDY3 377 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TFAP2BQ92481 460 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SLC9A6Q92581 669 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MAML1Q92585 1016 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TTC17Q96AE7 1141 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FAM136AQ96C01 138 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 APIPQ96GX9 242 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 NELL2Q99435 816 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PTDSS2Q9BVG9 487 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 KIAA1586Q9HCI6 787 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.52□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 A0A1W2PRQ8 180 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 VWC2LB2RUY7 222 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ADM5C9JUS6 153 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MPPED1O15442 326 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RRP9O43818 475 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 HMMRO75330 724 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PDHA1P08559 390 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PPIFP30405 207 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CXCR5P32302 372 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 WNT3P56703 355 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZBED6P86452 979 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SATB1Q01826 763 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PTPRRQ15256 657 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ALFQ53S48 1182 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 C3orf38Q5JPI3 329 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 HYIQ5T013 277 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 KAZNQ674X7 775 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZNF280BQ86YH2 543 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LMNTD2Q8IXW0 634 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 FKBP10Q96AY3 582 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 CDHR1Q96JP9 859 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MESP1Q9BRJ9 268 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 APOL5Q9BWW9 433 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ZNF287Q9HBT7 754 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 LUZP4Q9P127 313 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PRDM4Q9UKN5 801 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 OGDHLQ9ULD0 1010 aa4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ADGRA2Q96PE1 1338 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 PPM1DO15297 605 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 ORC4O43929 436 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 TCEA3O75764 348 aa4.5□□□□□ -1.69
CCDC18-AS1-210ENST00000436200 HOXC13P31276 330 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms