RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADGRF2Q8IZF7 708 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C3orf20Q8ND61 904 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 JOSD2Q8TAC2 188 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PAAF1Q9BRP4 392 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USTQ9Y2C2 406 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ALPK3Q96L96 1907 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTC3P53804 2025 aa10.37□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC151A5D8V7 595 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PIK3R2O00459 728 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TADA2AO75478 443 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYBL2P10244 700 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ACRP10323 421 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC130P13994 396 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TCF4P15884 667 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PCSK1P29120 753 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAN1A1P33908 653 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC1A1P43005 524 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RGS7P49802 495 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GSCP56915 257 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RWDD2BP57060 319 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC142Q17RM4 750 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SEL1L2Q5TEA6 688 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ARHGAP17Q68EM7 881 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C8orf74Q6P047 294 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMCO3Q6UWJ1 677 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 OTOP2Q7RTS6 562 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 THEM5Q8N1Q8 247 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C3orf58Q8NDZ4 430 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C18orf8Q96DM3 657 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MCRS1Q96EZ8 462 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SENP8Q96LD8 212 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC9A7Q96T83 725 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AAASQ9NRG9 546 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IP6K2Q9UHH9 426 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10.36□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TET1Q8NFU7 2136 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIGLEC16A6NMB1 481 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 F8VP50 259 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ATP2C2O75185 946 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDHD2O94830 711 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GLI1P08151 1106 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TYMPP19971 482 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADORA2BP29275 332 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GJC1P36383 396 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PDE4CQ08493 712 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LLGL1Q15334 1064 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WSCD1Q658N2 575 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PMF1Q6P1K2 205 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DCUN1D2Q6PH85 259 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD300LGQ6UXG3 332 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF365Q70YC5 407 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF280BQ86YH2 543 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SUSD3Q96L08 255 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 YME1L1Q96TA2 773 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERPUD2Q9BSE4 406 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYNCQ9H7C4 482 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STK39Q9UEW8 545 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADAM28Q9UKQ2 775 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STRIP2Q9ULQ0 834 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BRCA2P51587 3418 aa10.35□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSC2P49815 1807 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 E5RJQ4 531 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC188H7C350 402 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 M0QZQ0 153 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SYN3O14994 580 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CYP11A1P05108 521 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT3P12035 628 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LAG3P18627 525 aa10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SSR1P43307 286 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms