RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 SOX11P35716 441 aa22.21■■□□□ 1.15
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ANKRD28-201ENST00000399451 ZFP42Q96MM3 310 aa22.19■■□□□ 1.14
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ANKRD28-201ENST00000399451 KRT87PA6NCN2 255 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC159P0C7I6 412 aa22.18■■□□□ 1.14
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ANKRD28-201ENST00000399451 DUSP10Q9Y6W6 482 aa22.18■■□□□ 1.14
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ANKRD28-201ENST00000399451 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.18■■□□□ 1.14
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ANKRD28-201ENST00000399451 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM60Q495X7 471 aa22.18■■□□□ 1.14
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ANKRD28-201ENST00000399451 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 ICAM1P05362 532 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 SERPINB3P29508 390 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 SGO1Q5FBB7 561 aa22.17■■□□□ 1.14
ANKRD28-201ENST00000399451 TTI2Q6NXR4 508 aa22.17■■□□□ 1.14
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