RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 PKDCCQ504Y2 493 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 LLGL2Q6P1M3 1020 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 VSTM1Q6UX27 236 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 CLEC20AQ6ZU45 233 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 SCN4BQ8IWT1 228 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 REXO1L1PQ8IX06 675 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 KCNK16Q96T55 309 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 SMOQ99835 787 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 IGFLR1Q9H665 355 aa31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
ECHS1-201ENST00000368547 LCA5LO95447 670 aa31.26■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 GRIK1P39086 918 aa31.26■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 MAP3K7CLP57077 242 aa31.26■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 KRT83P78385 493 aa31.26■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 HYAL1Q12794 435 aa31.26■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 DEFB123Q8N688 67 aa31.26■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa31.26■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 TUFMP49411 452 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 RBM10P98175 930 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 PDE4CQ08493 712 aa31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 BST2Q10589 180 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
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ECHS1-201ENST00000368547 DESI2Q9BSY9 194 aa31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 MAN1C1Q9NR34 630 aa31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 F8VP50 259 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 TNFAIP3P21580 790 aa31.24■■■□□ 2.59
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ECHS1-201ENST00000368547 SLC8A3P57103 927 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 DDR2Q16832 855 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 LIN9Q5TKA1 542 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 ZMIZ2Q8NF64 920 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 OLIG1Q8TAK6 271 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 SLC7A14Q8TBB6 771 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 MYLIPQ8WY64 445 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 LHX5Q9H2C1 402 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 DEF6Q9H4E7 631 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 INSL5Q9Y5Q6 135 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 GPD2P43304 727 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 KIF11P52732 1056 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC149Q6ZUS6 474 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 PCDHB18PQ96TA0 734 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 YIPF1Q9Y548 306 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 CEP83Q9Y592 693 aa31.24■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 PATJQ8NI35 1801 aa31.23■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 TULP2O00295 520 aa31.23■■■□□ 2.59
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ECHS1-201ENST00000368547 SETSIPP0DME0 302 aa31.23■■■□□ 2.59
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ECHS1-201ENST00000368547 ZNF662Q6ZS27 426 aa31.23■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 NYAP1Q6ZVC0 841 aa31.23■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 WDTC1Q8N5D0 677 aa31.23■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 VN1R2Q8NFZ6 395 aa31.23■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 TUBB4AP04350 444 aa31.22■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 ATF6P18850 670 aa31.22■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
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ECHS1-201ENST00000368547 MICALL1Q8N3F8 863 aa31.22■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35F5Q8WV83 523 aa31.22■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 C8orf48Q96LL4 319 aa31.22■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 DPP7Q9UHL4 492 aa31.22■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 FAM170AA1A519 330 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 AKR1B10O60218 316 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 ALDH1A3P47895 512 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 SPA17Q15506 151 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 TRIM72Q6ZMU5 477 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 VPS36Q86VN1 386 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 EFHBQ8N7U6 833 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM35BQ8NCS4 154 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 ACRBPQ8NEB7 543 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 HDAC7Q8WUI4 952 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 GUCD1Q96NT3 240 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 CYTH4Q9UIA0 394 aa31.21■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP31.2■■■□□ 2.594e-10■■■■□ 19.9
ECHS1-201ENST00000368547 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 LSM8O95777 96 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 TWF1Q12792 350 aa31.2■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 PIGZQ86VD9 579 aa31.2■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 GPR152Q8TDT2 470 aa31.2■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
ECHS1-201ENST00000368547 LINC01565O15544 149 aa31.2■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 PLA2G4AP47712 749 aa31.2■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 NOMO3P69849 1222 aa31.2■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 PMF1Q6P1K2 205 aa31.2■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 STKLD1Q8NE28 680 aa31.2■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 HHLA1C9JL84 531 aa31.19■■■□□ 2.58
ECHS1-201ENST00000368547 SLC18A3Q16572 532 aa31.19■■■□□ 2.58
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