RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330295.9

CTHRC1-201, Transcript of collagen triple helix repeat containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTHRC1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1-201ENST00000330295 KCNH2Q12809 1159 aa15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 STK3Q13188 491 aa15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 MED8Q96G25 268 aa15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 TMEM176AQ96HP8 235 aa15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 NRSN2Q9GZP1 204 aa15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CTHRC1-201ENST00000330295 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 K7ERI5 159 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 DEXIO95424 95 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 MCF2P10911 925 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 TCF3P15923 654 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 XBP1P17861 261 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ADSSP30520 456 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 GRIA2P42262 883 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 TNFRSF4P43489 277 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 BNC1Q01954 994 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 GALNT17Q6IS24 598 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 STKLD1Q8NE28 680 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 DNASE2BQ8WZ79 361 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 TRIM4Q9C037 500 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.95■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 CSH1P0DML2 217 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 CSH2P0DML3 217 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ODC1P11926 461 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 RESTQ13127 1097 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ENGASEQ8NFI3 743 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 TTC9Q92623 222 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 IFT74Q96LB3 600 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 CD93Q9NPY3 652 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 GMIPQ9P107 970 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 PCDHA12Q9UN75 941 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.94■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 MEI4A8MW99 385 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 HOXB2P14652 356 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 CYP11B2P19099 503 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 NDUFV2P19404 249 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 GRK6P43250 576 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 CLDN6P56747 220 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 TMPRSS3P57727 454 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 KDSRQ06136 332 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 SMARCB1Q12824 385 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ARHGAP40Q5TG30 622 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 C12orf40Q86WS4 652 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 OXER1Q8TDS5 423 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 WASF1Q92558 559 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 TCHPQ9BT92 498 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 GCNT4Q9P109 453 aa15.93■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 MYLKQ15746 1914 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 A0A1W2PQF6 199 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ABLIM1O14639 778 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 BRINP1O60477 761 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 PFKFB2O60825 505 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 GABBR2O75899 941 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 HARSP12081 509 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 GP1BBP13224 206 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 KRT10P13645 584 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 PROZP22891 400 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ACTN2P35609 894 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 GPR15P49685 360 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 SPAG1Q07617 926 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 DHCR24Q15392 516 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 PADI6Q6TGC4 694 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 MPZL3Q6UWV2 235 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ERICH1Q86X53 443 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 KCNV2Q8TDN2 545 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 LRRC15Q8TF66 581 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 SENP8Q96LD8 212 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 LGMNQ99538 433 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 CPNE5Q9HCH3 593 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa15.92■□□□□ 0.14
CTHRC1-201ENST00000330295 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms