RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 MFSD5Q6N075 450 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 OR6B3Q8NGW1 331 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 MDM1Q8TC05 714 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RAB6CQ9H0N0 254 aa24■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 E7EVH7 732 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SGK1O00141 431 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 NLRP14Q86W24 1093 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 Q9Y3F1 56 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PIRO00625 290 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 HCRTO43612 131 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 MMP13P45452 471 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RELL1Q8IUW5 271 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 APBA2Q99767 749 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.99■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 EBAG9O00559 213 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
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SNX18-201ENST00000326277 OLFML1Q6UWY5 402 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 UNC93AQ86WB7 457 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 TTC13Q8NBP0 860 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SLC35F5Q8WV83 523 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CCT8L2Q96SF2 557 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
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SNX18-201ENST00000326277 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PCDH9Q9HC56 1237 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 A8MXQ7 604 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 TRAPPC3O43617 180 aa23.98■■□□□ 1.43
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SNX18-201ENST00000326277 CD4P01730 458 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 IGHA2P01877 340 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SRLQ86TD4 932 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SESTD1Q86VW0 696 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RFX6Q8HWS3 928 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 IFNL1Q8IU54 200 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 C9orf72Q96LT7 481 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CALN1Q9BXU9 219 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 FOXP3Q9BZS1 431 aa23.98■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 C10orf88Q9H8K7 445 aa23.98■■□□□ 1.43
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SNX18-201ENST00000326277 GABBR2O75899 941 aa23.96■■□□□ 1.43
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SNX18-201ENST00000326277 CCDC14Q49A88 953 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 XKR4Q5GH76 650 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 C7orf31Q8N865 590 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 GMNCA6NCL1 334 aa23.96■■□□□ 1.43
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SNX18-201ENST00000326277 PDGFRBP09619 1106 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 FGFR1P11362 822 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 KCNE1P15382 129 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 HOXC8P31273 242 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 MAGEA4P43358 317 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 GDF10P55107 478 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 CCDC38Q502W7 563 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 IPPQ9Y573 584 aa23.96■■□□□ 1.43
SNX18-201ENST00000326277 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 ENDOD1O94919 500 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 CHN1P15882 459 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 ATP11AP98196 1134 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 SLC6A3Q01959 620 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 MMRN1Q13201 1228 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 MORF4L2Q15014 288 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 NME8Q8N427 588 aa23.95■■□□□ 1.42
SNX18-201ENST00000326277 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.95■■□□□ 1.42
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