RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 TNIP3Q96KP6 325 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 SLITRK1Q96PX8 696 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 DMAC2Q9NW81 257 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 HPSEQ9Y251 543 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa21.52■■□□□ 1.04
TTC9B-201ENST00000311308 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 NR3C1P04150 777 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ARSAP15289 507 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TCF3P15923 654 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 DRD1P21728 446 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 USP4Q13107 963 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM196Q5HYL7 178 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TTLL2Q9BWV7 592 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 GCNT4Q9P109 453 aa21.51■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 C2orf78A6NCI8 922 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SDHBP21912 280 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 CLDN10P78369 228 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 FBXO43Q4G163 708 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 CEP135Q66GS9 1140 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SLC22A12Q96S37 553 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ECT2Q9H8V3 914 aa21.5■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 NFATC1O95644 943 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ABL1P00519 1130 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 HOXA6P31267 233 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 FNTBP49356 437 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 WDR44Q5JSH3 913 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC26Q8TAB7 109 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 RIN3Q8TB24 985 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TMC2Q8TDI7 906 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TAF4BQ92750 862 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 MED10Q9BTT4 135 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.49■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 K7ESF4 209 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 IKBKBO14920 756 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 GJA4P35212 333 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 NDUFA8P51970 172 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 USP46P62068 366 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 FSTL4Q6MZW2 842 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 NUP93Q8N1F7 819 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA1958Q8N8K9 716 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 PDZD8Q8NEN9 1154 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 RMDN1Q96DB5 314 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 USP18Q9UMW8 372 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 NME7Q9Y5B8 376 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.48■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 A0A1W2PQ27 194 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 A0A1W2PQ64 194 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 A0A1W2PQD8 194 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 RHOBTB3O94955 611 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 YWHAQP27348 245 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 LMNB2Q03252 620 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TAF10Q12962 218 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 EML3Q32P44 896 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 ZACNQ401N2 412 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 CEP68Q76N32 757 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 CD101Q93033 1021 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 IMPG2Q9BZV3 1241 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.47■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 CLDN5O00501 218 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 MAPK13O15264 365 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 RNF40O75150 1001 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 RETP07949 1114 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 KRT13P13646 458 aa21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
TTC9B-201ENST00000311308 GALK1P51570 392 aa21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms