RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SVOPQ8N4V2 548 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 MREGQ8N565 214 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 IL12AP29459 219 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ALDH1A3P47895 512 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 FNTAP49354 379 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ACAD9Q9H845 621 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TSPAN4O14817 238 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CCNKO75909 580 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 NR3C1P04150 777 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 UQCRBP14927 111 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 VPS72Q15906 364 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 UBE2SQ16763 222 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 DEFB107AQ8IZN7 70 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 AFF2P51816 1311 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SLC1A1P43005 524 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RAD23AP54725 363 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PDZK1Q5T2W1 519 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PADI6Q6TGC4 694 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 BNIPLQ7Z465 357 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SLC35G2Q8TBE7 412 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CNPY3Q9BT09 278 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TM9SF1O15321 606 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CCNCP24863 283 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 FOXO4P98177 505 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 STILQ15468 1287 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TRIQKQ629K1 86 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RORBQ92753 470 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CLDN3O15551 220 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SLC15A2Q16348 729 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 GLYCTKQ8IVS8 523 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA16Q9BXB7 569 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CROTQ9UKG9 612 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 NEDD4P46934 1319 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 AAGABQ6PD74 315 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TAGAPQ8N103 731 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PTPRN2Q92932 1015 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 STK33Q9BYT3 514 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CDK17Q00537 523 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 RGL2O15211 777 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TPST1O60507 370 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 WEE2P0C1S8 567 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PSMB9P28065 219 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 CLCN2P51788 898 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 AQP5P55064 265 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 IFNEQ86WN2 208 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 DLG3Q92796 817 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 FAM111AQ96PZ2 611 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 PCMTD2Q9NV79 361 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM22Q9P0K1 906 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 ADAM30Q9UKF2 790 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PQ72 361 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 USP17L15C9J2P7 530 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
PTPRO-201ENST00000281171 C19orf81C9J6K1 198 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.7 ms