RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 FAM153CQ494X1 144 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TFDP3Q5H9I0 405 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SAMD15Q9P1V8 674 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 FAM153AQ9UHL3 310 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TTLL3Q9Y4R7 772 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TSPAN1O60635 241 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 KRT15P19012 456 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CCL23P55773 120 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PRELID2Q8N945 189 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TTC25Q96NG3 672 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SYT11Q9BT88 431 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 LHX5Q9H2C1 402 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RSAD1Q9HA92 442 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PCDHGC3Q9UN70 934 aa11.13□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MICAL2O94851 1124 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RANBP1P43487 201 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 GPS1Q13098 491 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ACOT1Q86TX2 421 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 USP6NLQ92738 828 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 KLK14Q9P0G3 267 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 FSCN2O14926 492 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PDGFRBP09619 1106 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ARSEP51690 589 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ATP11AP98196 1134 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ACAP1Q15027 740 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 AADACL2Q6P093 401 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ATG4AQ8WYN0 398 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TSPAN18Q96SJ8 248 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DCLK3Q9C098 648 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC19Q9H756 370 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM59LQ9UK28 342 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 NENFQ9UMX5 172 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RECQL4O94761 1208 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 BEX3Q00994 111 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SPDYCQ5MJ68 293 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SAPCD2Q86UD0 394 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PDIK1LQ8N165 341 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CNPY3Q9BT09 278 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MINDY3Q9H8M7 445 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TSPAN16Q9UKR8 245 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ZBED1O96006 694 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 VIMP08670 466 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DARSP14868 501 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SLCO1A2P46721 670 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 BOLA3Q53S33 107 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PGBD3Q8N328 593 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 SAYSD1Q9NPB0 183 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 COX16Q9P0S2 106 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PTPRJQ12913 1337 aa11.12□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PIK3R2O00459 728 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 GPR182O15218 404 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ARL4CP56559 192 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PPP2R2AP63151 447 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PTP4A2Q12974 167 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TMC3Q7Z5M5 1100 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 UNC93AQ86WB7 457 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 LRRC52Q8N7C0 313 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PGBD4Q96DM1 585 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CST8O60676 142 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 RARGP13631 454 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 BCAT1P54687 386 aa11.11□□□□□ -0.63
PRRX1-201ENST00000239461 BCAR1P56945 870 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms