RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000217195.12

C20orf27-201, Transcript of chromosome 20 open reading frame 27, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C20orf27, Length 1,302 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27-201ENST00000217195 OVCA2Q8WZ82 227 aa20.85■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 TSG101Q99816 390 aa20.85■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 SMYD3Q9H7B4 428 aa20.85■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 GKN1Q9NS71 199 aa20.85■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 COMMD8Q9NX08 183 aa20.85■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.85■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 GTSE1Q9NYZ3 720 aa20.85■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.85■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 CETN3O15182 167 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 AKAP3O75969 853 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 VNN1O95497 513 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 CHRNB1P11230 501 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 HDCP19113 662 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 PPP1R2P41236 205 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 DLG4P78352 724 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 MTAPQ13126 283 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 MTF1Q14872 753 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC142Q17RM4 750 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 CPA6Q8N4T0 437 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 TTC39CQ8N584 583 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 ATP2A3Q93084 1043 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 CYP3A43Q9HB55 503 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa20.84■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 EPB41P11171 864 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 USP4Q13107 963 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 NR1H3Q13133 447 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 NUP93Q8N1F7 819 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 STKLD1Q8NE28 680 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 MED10Q9BTT4 135 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 TMEM8AQ9HCN3 771 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 GCNT4Q9P109 453 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 CCL26Q9Y258 94 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 R4GN57 208 aa20.83■□□□□ 0.93
C20orf27-201ENST00000217195 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 HLA-DRAP01903 254 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 IFNAR2P48551 515 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.923e-7■■■□□ 17.5
C20orf27-201ENST00000217195 STIM1Q13586 685 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF77Q15935 545 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 KRT39Q6A163 491 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 CRYBG2Q8N1P7 616 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ZBTB44Q8NCP5 570 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 NELL1Q92832 810 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 SMARCE1Q969G3 411 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 B3GNT5Q9BYG0 378 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 PATJQ8NI35 1801 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 DENND4CQ5VZ89 1909 aa20.82■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 YWHAQP27348 245 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 CXCL12P48061 93 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 CDH8P55286 799 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 TNK2Q07912 1038 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 PNOCQ13519 176 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 FAM35AQ86V20 835 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ADSSL1Q8N142 457 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 SPATA20Q8TB22 786 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 NIF3L1Q9GZT8 377 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 NME7Q9Y5B8 376 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 COL4A3Q01955 1670 aa20.81■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ATG13O75143 517 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 ASPAP45381 313 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 SOX9P48436 509 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 SLC7A9P82251 487 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 LRRC63Q05C16 580 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 INCA1Q0VD86 236 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 CCINQ13939 588 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 EBF3Q9H4W6 596 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 HPS4Q9NQG7 708 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 FAM186AA6NE01 2351 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 PTPRDP23468 1912 aa20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
C20orf27-201ENST00000217195 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.2 ms