RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 ADCY2Q08462 1091 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM110Q86TL2 294 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ANKRD52Q8NB46 1076 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ARL8AQ96BM9 186 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 USP18Q9UMW8 372 aa25.15■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 CYB561D2O14569 222 aa25.14■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 PCK1P35558 622 aa25.14■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 ADCY8P40145 1251 aa25.14■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC6A3Q01959 620 aa25.14■■□□□ 1.62
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RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC89Q8N998 374 aa25.14■■□□□ 1.62
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RPUSD1-201ENST00000007264 LPPQ93052 612 aa25.14■■□□□ 1.62
RPUSD1-201ENST00000007264 TXLNGYQ9BZA5 131 aa25.14■■□□□ 1.62
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RPUSD1-201ENST00000007264 TTMPQ5BVD1 217 aa25.14■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 OLFML1Q6UWY5 402 aa25.14■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 LIMS2Q7Z4I7 341 aa25.14■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 SCUBE3Q8IX30 993 aa25.14■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 HSPH1Q92598 858 aa25.14■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF148Q9UQR1 794 aa25.14■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 EFR3BQ9Y2G0 817 aa25.14■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.14■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 KDELR1P24390 212 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 LMAN1P49257 510 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGA7Q13683 1181 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 SLMAPQ14BN4 828 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 RAET1EQ8TD07 263 aa25.13■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 TRPA1O75762 1119 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CABYRO75952 493 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CDO1Q16878 200 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2W6PQ8NHA6 318 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC2A14Q8TDB8 520 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 DNPEPQ9ULA0 475 aa25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ARL5CA6NH57 179 aa25.12■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 RAB27AP51159 221 aa25.12■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC8A3P57103 927 aa25.12■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa25.12■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 HAUS1Q96CS2 278 aa25.12■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 CENPHQ9H3R5 247 aa25.12■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 SDC4P31431 198 aa25.11■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 PLCB3Q01970 1234 aa25.11■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 RNF169Q8NCN4 708 aa25.11■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 BBOF1Q8ND07 529 aa25.11■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 CCHCR1Q8TD31 782 aa25.11■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 ACADSBP45954 432 aa25.11■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 DYNLT1P63172 113 aa25.11■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 OSTM1Q86WC4 334 aa25.11■■□□□ 1.61
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RPUSD1-201ENST00000007264 CALN1Q9BXU9 219 aa25.11■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 CYLDQ9NQC7 956 aa25.11■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM163BP0C2L3 166 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ACLYP53396 1101 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF844Q08AG5 666 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 TAF5Q15542 800 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa25.1■■□□□ 1.61
RPUSD1-201ENST00000007264 WSCD1Q658N2 575 aa25.1■■□□□ 1.61
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