RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TecP24604 630 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nr2f2P43135 414 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc7a1Q09143 622 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tbc1d12Q6A039 696 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpsm1Q6IR34 673 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Styk1Q6J9G1 429 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tatdn1Q6P8M1 295 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf139Q7TMV1 668 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cfap100Q80VN0 613 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Epb41l5Q8BGS1 731 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B3glctQ8BHT6 489 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chtf18Q8BIW9 969 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc24Q8BYG0 334 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GanQ8CA72 597 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Naa30Q8CES0 364 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc8a2Q8K596 921 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ap3m2Q8R2R9 418 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmx1Q8VBT0 278 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3d19Q91X43 789 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdha1Q91Y21 948 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pde2aQ922S4 916 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpxm2Q9D2L5 764 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ca7Q9ERQ8 264 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vnn1Q9Z0K8 512 aa11.89□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfc3h1B2RT41 1992 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dopey2Q3UHQ6 2295 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc38A3KMP2 465 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 GcP21614 476 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CtrcQ3SYP2 268 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rapgef1Q3UHC1 1224 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kdm7aQ3UWM4 940 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pik3r5Q5SW28 871 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pde1cQ64338 706 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf787Q8BIF9 381 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nipal1Q8BMW7 416 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam163bQ8BUM6 167 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SucoQ8C341 1250 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc38Q8CDN8 563 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pop1Q8K205 1045 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SharpinQ91WA6 380 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q91Z58 1206 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif17Q99PW8 1038 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhobtb3Q9CTN4 611 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Marc1Q9CW42 340 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kif12Q9D2Z8 642 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cfap53Q9D439 514 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q9D454 513 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mss51Q9D5Z5 446 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nme7Q9QXL8 395 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PtprfA2A8L5 1898 aa11.88□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tex13aA2AFS9 377 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc73B2RWC4 316 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn1r88E9Q235 316 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r15L7N2A0 855 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prl2c2P04095 224 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IhhP97812 411 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem109Q3UBX0 243 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Creb3Q61817 404 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RbfaQ6P3B9 350 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ints8Q80V86 995 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem87aQ8BXN9 555 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Setdb2Q8C267 713 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pnma3Q8JZW8 466 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lgi4Q8K1S1 537 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1499Q8VG65 314 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam3cQ91VU0 227 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MtapQ9CQ65 283 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcyox1Q9CQF9 505 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mms19Q9D071 1031 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam174aQ9D3L0 190 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sv2aQ9JIS5 742 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DexiQ9WUQ7 95 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tnni1Q9WUZ5 187 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Apobec2Q9WV35 224 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ate1Q9Z2A5 516 aa11.87□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kat6aQ8BZ21 2003 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sycp2lA0A0M3U1B0 842 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rap1gapA2ALS5 663 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxpe3B9EKK6 559 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2t4E9PWV0 503 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf568E9PYI1 671 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8298J3QPI0 401 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdc2P43407 202 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rpl13P47963 211 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx6P54823 483 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Htr4P97288 388 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh8P97291 799 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zc3h18Q0P678 948 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Aarsd1Q3THG9 412 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Frmd8Q3UFK8 466 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bbof1Q3V079 533 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abi3Q8BYZ1 367 aa11.86□□□□□ -0.51
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr27Q8C5V5 780 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.3 ms