RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019749.3

Hoxd8-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd8, Length 2,634 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Unc5cO08747 931 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 CenpuQ8C4M7 410 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lonp1Q8CGK3 949 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Setd3Q91WC0 594 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trps1Q925H1 1281 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mrps22Q9CXW2 359 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp8b4A2ANX3 1194 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mroh5E9PUJ8 762 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nrg3O35181 713 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Fcer2P20693 331 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ccnd3P30282 292 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc17a7Q3TXX4 560 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Txndc8Q69AB2 127 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ssxb5Q6XAS2 159 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc9a4Q8BUE1 797 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arid2E9Q7E2 1828 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zc3h12bG3X9I7 835 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pias1O88907 651 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Elk3P41971 409 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GclcP97494 637 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cdk16Q04735 496 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tfdp2Q64163 446 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 OcrlQ6NVF0 900 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Wdr27Q8C5V5 780 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cwf19l1Q8CI33 537 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rpa1Q8VEE4 623 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mbd1Q9Z2E2 636 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp94E9Q6Y4 486 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gnl1P36916 607 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gabrb2P63137 512 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Pnpla5Q32LZ8 432 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Psg28Q4KL66 472 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Mtmr10Q7TPM9 771 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spata20Q80YT5 790 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Map1sQ8C052 973 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Adi1Q99JT9 179 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Polr3cQ9D483 533 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Akt3Q9WUA6 479 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Scn1aA2APX8 2009 aa27.39■■□□□ 1.98
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slfn8B1ARD8 910 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Znf746Q3U133 652 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Cfhr2Q4LDF6 332 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Frmd4aQ8BIE6 1020 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PdgfcQ8CI19 345 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zbtb44Q8R0A2 453 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snap47Q8R570 413 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rnf112Q96DY5 654 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PnkpQ9JLV6 522 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PotegA5H0M4 473 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r59E9PUT5 865 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kng1O08677 661 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 GsrP47791 500 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Arf4P61750 180 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Rbl2Q64700 1135 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Snrnp25Q8VIK1 123 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tlr9Q9EQU3 1032 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Hao1Q9WU19 370 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Zfp990B1AVN5 605 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Olfm4Q3UZZ4 505 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm14685Q52KH6 695 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Slc9b2Q5BKR2 547 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sh3rf1Q69ZI1 892 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Daam1Q8BPM0 1077 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Bag2Q91YN9 210 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Eif4e3Q9DBB5 207 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vwa7Q9JHA8 891 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm11985A0A1B0GS61 206 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 ChukQ60680 745 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Spa17Q62252 149 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Klhdc10Q6PAR0 439 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trnp1Q80ZI1 223 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Lpin3Q99PI4 848 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 PirQ9D711 290 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Plscr2Q9DCW2 307 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Atp13a1Q9EPE9 1200 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Krt16Q9Z2K1 469 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 1700031M16RikA0A087WSH0 82 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 AlpiF8VPQ6 554 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Vmn2r39L7N2E5 861 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Glb1P23780 647 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gjb3P28231 270 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Nlrc4Q3UP24 1024 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Trim24Q64127 1051 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 WtipQ7TQJ8 398 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Kcng2F7A6P6 480 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Csde1Q91W50 798 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm3424L7N298 263 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Gm8246M0QWX9 263 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Sash1P59808 1230 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Foxn1Q61575 648 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd8-201ENSMUST00000019749 Tll1Q62381 1013 aa27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.1 ms