RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	UBR2	Q07963	1872 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	HAP3	P13434	144 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	KEI1	Q06346	221 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	ERG25	P53045	309 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YCL001W-A	P87012	153 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YCR099C	P25657	155 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	UIP4	Q08926	304 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
TYW1	YPL207W	YKL044W	P36092	106 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	SNF11	P38956	169 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	GTT2	Q12390	233 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	SCM4	P32564	187 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YBR032W	P38223	100 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	BOL2	P53082	120 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	PEP8	P40335	379 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YFR035C	P43608	114 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YGR164W	P53291	111 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	PIR1	Q03178	341 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	ATG41	Q12048	136 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	ATG40	Q99325	256 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YHR130C	P38834	111 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	UPS3	Q04006	179 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	IRC19	Q07843	230 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	COX5B	P00425	151 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	PEX4	P29340	183 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	CLB6	P32943	380 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YER084W	P40057	128 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YIL059C	P40520	121 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	KNH1	P50112	268 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YGL260W	P53056	76 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	ATP19	P81451	68 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	SOM1	Q05676	74 aa		3.15	□□□□□ -1.9
TYW1	YPL207W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	TIR3	P40552	269 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	TDA2	P40045	126 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YPR013C	Q12145	317 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	FYV5	P25585	152 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	QCR10	P37299	77 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YHP1	Q04116	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YEL067C	P39978	195 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	ERV14	P53173	138 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	GRX5	Q02784	150 aa		3.12	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YML079W	Q03629	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	GPI19	Q04082	140 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YPR117W	Q06116	2489 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	MSB2	P32334	1306 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YGL010W	P25338	174 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YEL045C	P32616	141 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YPR195C	Q06594	109 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	MIC10	Q96VH5	97 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	SPO73	P40031	143 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	YGR269W	P40326	108 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	UTH1	P36135	365 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	DAD4	P69851	72 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	RAF1	Q06891	181 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	RAD28	Q12021	506 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	FIT1	Q04433	528 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TYW1	YPL207W	UBC4	P15731	148 aa		3.09	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	SEC11	P15367	167 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	YBR209W	P38311	105 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	CIS3	P47001	227 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	YDR029W	Q12111	104 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	GTT1	P40582	234 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	YJR146W	P47174	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	FIT3	Q08907	204 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	ECM31	P38122	312 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	COX8	P04039	78 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	MRPL44	P19956	98 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	UTR5	P32630	166 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	YGL149W	P53116	101 aa		3.06	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	PAU21	P0CE86	164 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	PAU22	P0CE87	164 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	HSP10	P38910	106 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	PAU12	P53343	120 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	MET31	Q03081	177 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	HMRA1	P0CY11	126 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	MRPS9	P38120	278 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	SEN15	Q04675	128 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TYW1	YPL207W	VPS68	Q12016	184 aa		3.05	□□□□□ -1.92

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