RNA–Protein interactions for RNA: YHR048W

YHK8, Transcript of Presumed antiporter of the major facilitator superfamily, yeast

Gene YHK8, Length 1,545 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YHK8	YHR048W	SDS23	P53172	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	BRP1	P53194	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	TVP18	Q04767	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	CYT2	Q00873	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	AIM34	Q03673	198 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	YOL085C	Q99345	113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YHK8	YHR048W	MRPL33	P20084	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YGL118C	P53132	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	VHS2	P40463	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	ARL3	Q02804	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	SGF11	Q03067	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	DXO1	Q06349	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	TEM1	P38987	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YGR149W	P48236	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	MED7	Q08278	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	VAM10	Q08474	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	MRPL28	P36527	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	SSS1	P35179	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	RRT13	P40042	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YPS5	P53057	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YGR240C-A	Q3E786	66 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	COA6	Q3E846	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YCR001W	P25347	104 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YFR035C	P43608	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	SCW10	Q04951	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	YLR042C	Q07990	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	NRG2	P38082	220 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	ERV14	P53173	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	PMP3	P87284	55 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YHK8	YHR048W	SAL1	D6W196	494 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YNL217W	P40152	326 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	HAL1	Q01766	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	PFY1	P07274	126 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YCR023C	P25351	611 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YKR032W	P36127	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	SDH8	P38345	138 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YER076C	P40049	302 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	DCV1	P43595	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	ATP23	P53722	227 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	MGR2	Q02889	113 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	DGA1	Q08650	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	AUA1	P32450	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	GLO1	P50107	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YRA2	P36036	203 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
YHK8	YHR048W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	TOS6	P48560	102 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	CNL1	Q06333	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	CRC1	Q12289	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	KRE9	P39005	276 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YER134C	P40081	178 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	OST3	P48439	350 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	CGR1	P53188	120 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	PET8	P38921	284 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	SPC1	P46965	94 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	UBC5	P15732	148 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	PCL2	P25693	308 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	MRP49	P32388	137 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YIL014C-A	Q02598	104 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YHK8	YHR048W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHK8	YHR048W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHK8	YHR048W	PAU16	P35994	123 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHK8	YHR048W	YDR042C	Q03205	200 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHK8	YHR048W	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
YHK8	YHR048W	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHK8	YHR048W	TRP1	P00912	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHK8	YHR048W	APS1	P35181	156 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YHK8	YHR048W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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