RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	HAP3	P13434	144 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	INO4	P13902	151 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	CLB6	P32943	380 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	CCS1	P40202	249 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	PIR5	P46999	287 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	SCP1	Q08873	200 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	FEX1	Q08913	375 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	FEX2	Q08991	375 aa		2.98	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	RPS23B	P0CX30	145 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	RPL33B	P41056	107 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YFL012W	P43580	148 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YPR174C	Q06616	221 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	RIP-Chip
SYF1	YDR416W	ERG25	P53045	309 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	PIR1	Q03178	341 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	UPS3	Q04006	179 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SYF1	YDR416W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YDL241W	Q07738	123 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	GTT2	Q12390	233 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YLR236C	A0A023PZG4	107 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	ATG41	Q12048	136 aa		2.96	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	TOM1	Q03280	3268 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YKL044W	P36092	106 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	SNF11	P38956	169 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	TIR3	P40552	269 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YFR035C	P43608	114 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	BOL2	P53082	120 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YCL001W-A	P87012	153 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	SOM1	Q05676	74 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	IRC19	Q07843	230 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YPR013C	Q12145	317 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YML079W	Q03629	201 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YHP1	Q04116	353 aa		2.95	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	TEL1	P38110	2787 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	MAK31	P23059	88 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	QCR10	P37299	77 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	TDA2	P40045	126 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	COX5B	P00425	151 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	PEX4	P29340	183 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YHR130C	P38834	111 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YIL059C	P40520	121 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YMR090W	Q04304	227 aa	Known RBP	2.94	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YEL045C	P32616	141 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YEL067C	P39978	195 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	KNH1	P50112	268 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	RAF1	Q06891	181 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	LAA1	P39526	2014 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	ERV14	P53173	138 aa		2.93	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YBR209W	P38311	105 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	FYV5	P25585	152 aa		2.92	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YGL010W	P25338	174 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YER084W	P40057	128 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YGR269W	P40326	108 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	FIT1	Q04433	528 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	CIS3	P47001	227 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	RAD28	Q12021	506 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	MRPL44	P19956	98 aa		2.9	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	UTH1	P36135	365 aa		2.9	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	MRPS9	P38120	278 aa		2.9	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	GPI19	Q04082	140 aa		2.9	□□□□□ -1.94
SYF1	YDR416W	DAD4	P69851	72 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	YPR195C	Q06594	109 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	MSB2	P32334	1306 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	ECM31	P38122	312 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	YDR114C	Q04597	100 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	SEC11	P15367	167 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	UBC4	P15731	148 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	MIC10	Q96VH5	97 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	SWC7	Q06707	132 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	HSP10	P38910	106 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	COA6	Q3E846	104 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	COX8	P04039	78 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	GTT1	P40582	234 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	FIT3	Q08907	204 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	PAU21	P0CE86	164 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	PAU22	P0CE87	164 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	SVP26	P38869	228 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	YDL157C	Q12082	118 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	YOS1	Q3E834	85 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	SPO73	P40031	143 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	YJR146W	P47174	117 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	NAT5	Q08689	176 aa		2.86	□□□□□ -1.95
SYF1	YDR416W	YDR029W	Q12111	104 aa		2.86	□□□□□ -1.95

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