RNA–Protein interactions for RNA: YDR385W

EFT2, Transcript of Elongation factor 2 (EF-2), also encoded by EFT1, yeast

Gene EFT2, Length 2,529 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EFT2	YDR385W	PCL5	P38794	229 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YNR077C	P53758	84 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YPL261C	Q08976	102 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	AQY1	P0CD91	305 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	PET191	Q02772	108 aa		5.01	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	PET8	P38921	284 aa		5	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	GGC1	P38988	300 aa		5	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		5	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YFL019C	P43576	117 aa		5	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RLM1	Q12224	676 aa		5	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	SWD3	P38123	315 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	VEL1	P53058	206 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	NRM1	P53718	249 aa		4.99	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	UBC4	P15731	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	VHS2	P40463	436 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YIA6	P40556	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YFL051C	P43552	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YFR054C	P43622	192 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	IGO2	Q9P305	131 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	FLO9	P39712	1322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
EFT2	YDR385W	YER187W	P40102	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YGR050C	P53231	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YOR268C	Q08734	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YBR209W	P38311	105 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YHR180W	P38868	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
EFT2	YDR385W	HAL1	Q01766	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	EMC6	Q12431	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	ISF1	P32488	338 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	EAF6	P47128	113 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	TOM7	P53507	60 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	IRC23	Q08416	157 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YOR376W-A	Q3E805	51 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EFT2	YDR385W	MIX14	Q04341	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	DIF1	O13577	133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YGL034C	P53186	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	MXR2	P25566	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	PCL2	P25693	308 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	GAT4	P40569	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	CUZ1	P53899	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	ATP19	P81451	68 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	SIM1	P40472	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YNL046W	P53956	172 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YDR102C	Q03864	110 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YKR032W	P36127	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.94	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	PIR1	Q03178	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.93	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YSY6	P38374	65 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	PAU7	P39545	55 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	PIR5	P46999	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	PBA1	Q05778	276 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	SHH4	Q06236	168 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YHR173C	P38864	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YHP1	Q04116	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	TIM22	Q12328	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	DSS4	P32601	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YNL217W	P40152	326 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	KEG1	P43614	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	BLM10	P43583	2143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	PFY1	P07274	126 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	YNL234W	P53857	426 aa		4.9	□□□□□ -1.62
EFT2	YDR385W	MED6	P38782	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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